Protein–RNA interactions for Protein: A1A4V9

CCDC189, Coiled-coil domain-containing protein 189, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC189A1A4V9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC189A1A4V9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC189A1A4V9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC189A1A4V9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC189A1A4V9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC189A1A4V9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC189A1A4V9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC189A1A4V9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC189A1A4V9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC189A1A4V9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC189A1A4V9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC189A1A4V9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC189A1A4V9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC189A1A4V9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC189A1A4V9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC189A1A4V9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC189A1A4V9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC189A1A4V9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC189A1A4V9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC189A1A4V9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC189A1A4V9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC189A1A4V9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC189A1A4V9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC189A1A4V9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC189A1A4V9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC189A1A4V9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC189A1A4V9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC189A1A4V9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC189A1A4V9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC189A1A4V9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC189A1A4V9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC189A1A4V9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC189A1A4V9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC189A1A4V9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC189A1A4V9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC189A1A4V9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC189A1A4V9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC189A1A4V9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC189A1A4V9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC189A1A4V9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC189A1A4V9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC189A1A4V9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC189A1A4V9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC189A1A4V9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC189A1A4V9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC189A1A4V9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC189A1A4V9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC189A1A4V9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC189A1A4V9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC189A1A4V9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC189A1A4V9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC189A1A4V9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC189A1A4V9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC189A1A4V9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC189A1A4V9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC189A1A4V9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC189A1A4V9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC189A1A4V9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC189A1A4V9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC189A1A4V9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC189A1A4V9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC189A1A4V9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC189A1A4V9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC189A1A4V9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC189A1A4V9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC189A1A4V9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC189A1A4V9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC189A1A4V9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC189A1A4V9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC189A1A4V9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC189A1A4V9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC189A1A4V9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC189A1A4V9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC189A1A4V9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC189A1A4V9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC189A1A4V9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC189A1A4V9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC189A1A4V9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC189A1A4V9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC189A1A4V9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC189A1A4V9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC189A1A4V9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC189A1A4V9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC189A1A4V9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC189A1A4V9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC189A1A4V9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC189A1A4V9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC189A1A4V9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC189A1A4V9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC189A1A4V9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC189A1A4V9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC189A1A4V9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC189A1A4V9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC189A1A4V9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC189A1A4V9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC189A1A4V9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC189A1A4V9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC189A1A4V9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC189A1A4V9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC189A1A4V9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.7 ms