Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCSO14618 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCSO14618 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCSO14618 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCSO14618 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCSO14618 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCSO14618 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCSO14618 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCSO14618 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCSO14618 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCSO14618 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCSO14618 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCSO14618 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCSO14618 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCSO14618 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCSO14618 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCSO14618 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCSO14618 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCSO14618 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCSO14618 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCSO14618 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCSO14618 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCSO14618 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCSO14618 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCSO14618 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCSO14618 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCSO14618 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCSO14618 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCSO14618 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCSO14618 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCSO14618 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCSO14618 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCSO14618 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCSO14618 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCSO14618 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCSO14618 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCSO14618 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCSO14618 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCSO14618 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCSO14618 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCSO14618 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCSO14618 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCSO14618 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCSO14618 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCSO14618 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCSO14618 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCSO14618 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCSO14618 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCSO14618 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCSO14618 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCSO14618 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCSO14618 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCSO14618 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCSO14618 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCSO14618 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCSO14618 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCSO14618 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCSO14618 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCSO14618 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCSO14618 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCSO14618 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCSO14618 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCSO14618 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCSO14618 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCSO14618 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCSO14618 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCSO14618 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCSO14618 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCSO14618 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCSO14618 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCSO14618 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCSO14618 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCSO14618 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCSO14618 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCSO14618 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCSO14618 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCSO14618 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCSO14618 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCSO14618 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCSO14618 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCSO14618 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCSO14618 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCSO14618 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCSO14618 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCSO14618 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCSO14618 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCSO14618 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCSO14618 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCSO14618 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCSO14618 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCSO14618 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCSO14618 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCSO14618 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCSO14618 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCSO14618 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCSO14618 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCSO14618 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCSO14618 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCSO14618 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCSO14618 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms