Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCSO14618 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCSO14618 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCSO14618 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCSO14618 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCSO14618 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCSO14618 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCSO14618 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCSO14618 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCSO14618 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCSO14618 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCSO14618 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCSO14618 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCSO14618 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCSO14618 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCSO14618 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCSO14618 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCSO14618 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCSO14618 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCSO14618 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCSO14618 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCSO14618 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCSO14618 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCSO14618 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCSO14618 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCSO14618 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCSO14618 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCSO14618 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCSO14618 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCSO14618 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCSO14618 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCSO14618 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCSO14618 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCSO14618 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCSO14618 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCSO14618 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCSO14618 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCSO14618 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCSO14618 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCSO14618 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCSO14618 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCSO14618 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCSO14618 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCSO14618 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCSO14618 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCSO14618 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCSO14618 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCSO14618 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCSO14618 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCSO14618 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCSO14618 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCSO14618 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCSO14618 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCSO14618 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCSO14618 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCSO14618 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCSO14618 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCSO14618 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCSO14618 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCSO14618 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCSO14618 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCSO14618 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCSO14618 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCSO14618 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCSO14618 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCSO14618 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCSO14618 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCSO14618 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCSO14618 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCSO14618 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCSO14618 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCSO14618 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCSO14618 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCSO14618 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCSO14618 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCSO14618 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCSO14618 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCSO14618 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCSO14618 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCSO14618 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCSO14618 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCSO14618 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCSO14618 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCSO14618 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCSO14618 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCSO14618 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCSO14618 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCSO14618 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCSO14618 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCSO14618 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCSO14618 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCSO14618 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCSO14618 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCSO14618 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCSO14618 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCSO14618 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCSO14618 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCSO14618 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCSO14618 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCSO14618 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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