Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
U3KQE9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
U3KQE9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
U3KQE9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
U3KQE9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
U3KQE9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
U3KQE9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
U3KQE9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
U3KQE9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
U3KQE9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
U3KQE9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
U3KQE9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
U3KQE9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
U3KQE9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
U3KQE9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
U3KQE9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
U3KQE9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
U3KQE9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
U3KQE9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
U3KQE9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
U3KQE9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
U3KQE9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
U3KQE9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
U3KQE9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
U3KQE9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
U3KQE9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
U3KQE9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
U3KQE9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
U3KQE9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
U3KQE9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
U3KQE9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
U3KQE9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
U3KQE9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
U3KQE9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
U3KQE9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
U3KQE9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
U3KQE9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
U3KQE9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
U3KQE9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
U3KQE9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
U3KQE9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
U3KQE9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
U3KQE9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
U3KQE9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
U3KQE9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
U3KQE9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
U3KQE9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
U3KQE9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
U3KQE9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
U3KQE9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
U3KQE9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
U3KQE9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
U3KQE9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
U3KQE9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
U3KQE9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
U3KQE9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
U3KQE9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
U3KQE9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
U3KQE9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
U3KQE9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
U3KQE9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
U3KQE9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
U3KQE9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
U3KQE9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
U3KQE9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
U3KQE9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
U3KQE9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
U3KQE9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
U3KQE9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
U3KQE9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
U3KQE9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
U3KQE9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
U3KQE9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
U3KQE9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
U3KQE9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
U3KQE9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
U3KQE9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
U3KQE9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
U3KQE9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
U3KQE9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
U3KQE9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
U3KQE9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
U3KQE9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
U3KQE9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
U3KQE9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
U3KQE9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
U3KQE9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
U3KQE9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
U3KQE9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
U3KQE9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
U3KQE9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
U3KQE9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
U3KQE9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
U3KQE9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
U3KQE9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
U3KQE9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
U3KQE9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
U3KQE9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
U3KQE9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
U3KQE9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms