Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
GTF3C3Q9Y5Q9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
GTF3C3Q9Y5Q9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
GTF3C3Q9Y5Q9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
GTF3C3Q9Y5Q9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
GTF3C3Q9Y5Q9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
GTF3C3Q9Y5Q9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
GTF3C3Q9Y5Q9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
GTF3C3Q9Y5Q9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
GTF3C3Q9Y5Q9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
GTF3C3Q9Y5Q9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
GTF3C3Q9Y5Q9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
GTF3C3Q9Y5Q9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
GTF3C3Q9Y5Q9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
GTF3C3Q9Y5Q9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
GTF3C3Q9Y5Q9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
GTF3C3Q9Y5Q9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
GTF3C3Q9Y5Q9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
GTF3C3Q9Y5Q9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
GTF3C3Q9Y5Q9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
GTF3C3Q9Y5Q9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
GTF3C3Q9Y5Q9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
GTF3C3Q9Y5Q9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
GTF3C3Q9Y5Q9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
GTF3C3Q9Y5Q9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
GTF3C3Q9Y5Q9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
GTF3C3Q9Y5Q9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
GTF3C3Q9Y5Q9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
GTF3C3Q9Y5Q9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
GTF3C3Q9Y5Q9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
GTF3C3Q9Y5Q9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
GTF3C3Q9Y5Q9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
GTF3C3Q9Y5Q9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
GTF3C3Q9Y5Q9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
GTF3C3Q9Y5Q9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
GTF3C3Q9Y5Q9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
GTF3C3Q9Y5Q9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
GTF3C3Q9Y5Q9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
GTF3C3Q9Y5Q9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
GTF3C3Q9Y5Q9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
GTF3C3Q9Y5Q9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC33.82■■■■□ 3
GTF3C3Q9Y5Q9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
GTF3C3Q9Y5Q9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
GTF3C3Q9Y5Q9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
GTF3C3Q9Y5Q9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
GTF3C3Q9Y5Q9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
GTF3C3Q9Y5Q9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
GTF3C3Q9Y5Q9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
GTF3C3Q9Y5Q9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC33.8■■■■□ 3
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
GTF3C3Q9Y5Q9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
GTF3C3Q9Y5Q9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
GTF3C3Q9Y5Q9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
GTF3C3Q9Y5Q9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
GTF3C3Q9Y5Q9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC33.78■■■■□ 3
GTF3C3Q9Y5Q9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
GTF3C3Q9Y5Q9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
GTF3C3Q9Y5Q9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
GTF3C3Q9Y5Q9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
GTF3C3Q9Y5Q9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
GTF3C3Q9Y5Q9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
GTF3C3Q9Y5Q9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
GTF3C3Q9Y5Q9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
GTF3C3Q9Y5Q9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
GTF3C3Q9Y5Q9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
GTF3C3Q9Y5Q9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
GTF3C3Q9Y5Q9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
GTF3C3Q9Y5Q9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
GTF3C3Q9Y5Q9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
GTF3C3Q9Y5Q9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
GTF3C3Q9Y5Q9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
GTF3C3Q9Y5Q9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
GTF3C3Q9Y5Q9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
GTF3C3Q9Y5Q9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
GTF3C3Q9Y5Q9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
GTF3C3Q9Y5Q9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
GTF3C3Q9Y5Q9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
GTF3C3Q9Y5Q9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
GTF3C3Q9Y5Q9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
GTF3C3Q9Y5Q9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
GTF3C3Q9Y5Q9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
GTF3C3Q9Y5Q9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
GTF3C3Q9Y5Q9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
GTF3C3Q9Y5Q9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
GTF3C3Q9Y5Q9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
GTF3C3Q9Y5Q9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
GTF3C3Q9Y5Q9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms