Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PAXBP1Q9Y5B6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PAXBP1Q9Y5B6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PAXBP1Q9Y5B6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PAXBP1Q9Y5B6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PAXBP1Q9Y5B6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PAXBP1Q9Y5B6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PAXBP1Q9Y5B6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PAXBP1Q9Y5B6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PAXBP1Q9Y5B6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PAXBP1Q9Y5B6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PAXBP1Q9Y5B6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PAXBP1Q9Y5B6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PAXBP1Q9Y5B6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PAXBP1Q9Y5B6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PAXBP1Q9Y5B6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PAXBP1Q9Y5B6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PAXBP1Q9Y5B6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PAXBP1Q9Y5B6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
PAXBP1Q9Y5B6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PAXBP1Q9Y5B6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PAXBP1Q9Y5B6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PAXBP1Q9Y5B6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PAXBP1Q9Y5B6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PAXBP1Q9Y5B6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PAXBP1Q9Y5B6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PAXBP1Q9Y5B6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PAXBP1Q9Y5B6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PAXBP1Q9Y5B6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PAXBP1Q9Y5B6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PAXBP1Q9Y5B6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PAXBP1Q9Y5B6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PAXBP1Q9Y5B6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PAXBP1Q9Y5B6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PAXBP1Q9Y5B6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PAXBP1Q9Y5B6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PAXBP1Q9Y5B6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PAXBP1Q9Y5B6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PAXBP1Q9Y5B6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PAXBP1Q9Y5B6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PAXBP1Q9Y5B6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PAXBP1Q9Y5B6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PAXBP1Q9Y5B6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PAXBP1Q9Y5B6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PAXBP1Q9Y5B6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PAXBP1Q9Y5B6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PAXBP1Q9Y5B6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PAXBP1Q9Y5B6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PAXBP1Q9Y5B6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PAXBP1Q9Y5B6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PAXBP1Q9Y5B6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PAXBP1Q9Y5B6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PAXBP1Q9Y5B6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PAXBP1Q9Y5B6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PAXBP1Q9Y5B6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PAXBP1Q9Y5B6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PAXBP1Q9Y5B6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PAXBP1Q9Y5B6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PAXBP1Q9Y5B6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PAXBP1Q9Y5B6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PAXBP1Q9Y5B6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PAXBP1Q9Y5B6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PAXBP1Q9Y5B6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PAXBP1Q9Y5B6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PAXBP1Q9Y5B6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PAXBP1Q9Y5B6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PAXBP1Q9Y5B6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PAXBP1Q9Y5B6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PAXBP1Q9Y5B6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PAXBP1Q9Y5B6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PAXBP1Q9Y5B6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PAXBP1Q9Y5B6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PAXBP1Q9Y5B6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PAXBP1Q9Y5B6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PAXBP1Q9Y5B6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PAXBP1Q9Y5B6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PAXBP1Q9Y5B6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PAXBP1Q9Y5B6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PAXBP1Q9Y5B6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PAXBP1Q9Y5B6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PAXBP1Q9Y5B6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PAXBP1Q9Y5B6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PAXBP1Q9Y5B6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PAXBP1Q9Y5B6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PAXBP1Q9Y5B6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PAXBP1Q9Y5B6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PAXBP1Q9Y5B6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PAXBP1Q9Y5B6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PAXBP1Q9Y5B6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PAXBP1Q9Y5B6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PAXBP1Q9Y5B6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PAXBP1Q9Y5B6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PAXBP1Q9Y5B6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PAXBP1Q9Y5B6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PAXBP1Q9Y5B6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PAXBP1Q9Y5B6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms