Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y546

LRRC42, Leucine-rich repeat-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC42Q9Y546 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC42Q9Y546 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC42Q9Y546 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC42Q9Y546 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC42Q9Y546 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRC42Q9Y546 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRC42Q9Y546 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC42Q9Y546 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC42Q9Y546 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC42Q9Y546 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC42Q9Y546 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC42Q9Y546 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC42Q9Y546 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC42Q9Y546 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC42Q9Y546 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC42Q9Y546 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC42Q9Y546 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC42Q9Y546 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC42Q9Y546 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC42Q9Y546 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC42Q9Y546 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC42Q9Y546 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC42Q9Y546 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC42Q9Y546 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC42Q9Y546 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC42Q9Y546 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC42Q9Y546 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC42Q9Y546 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC42Q9Y546 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC42Q9Y546 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC42Q9Y546 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC42Q9Y546 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC42Q9Y546 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC42Q9Y546 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC42Q9Y546 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LRRC42Q9Y546 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LRRC42Q9Y546 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC42Q9Y546 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC42Q9Y546 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC42Q9Y546 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC42Q9Y546 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC42Q9Y546 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC42Q9Y546 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC42Q9Y546 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC42Q9Y546 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC42Q9Y546 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC42Q9Y546 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC42Q9Y546 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC42Q9Y546 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC42Q9Y546 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC42Q9Y546 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC42Q9Y546 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC42Q9Y546 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC42Q9Y546 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC42Q9Y546 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC42Q9Y546 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC42Q9Y546 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC42Q9Y546 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC42Q9Y546 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC42Q9Y546 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC42Q9Y546 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC42Q9Y546 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC42Q9Y546 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC42Q9Y546 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC42Q9Y546 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC42Q9Y546 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC42Q9Y546 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC42Q9Y546 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC42Q9Y546 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC42Q9Y546 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC42Q9Y546 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC42Q9Y546 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC42Q9Y546 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC42Q9Y546 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC42Q9Y546 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC42Q9Y546 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC42Q9Y546 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC42Q9Y546 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC42Q9Y546 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC42Q9Y546 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC42Q9Y546 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC42Q9Y546 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC42Q9Y546 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC42Q9Y546 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC42Q9Y546 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC42Q9Y546 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC42Q9Y546 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC42Q9Y546 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC42Q9Y546 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC42Q9Y546 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC42Q9Y546 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC42Q9Y546 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC42Q9Y546 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC42Q9Y546 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC42Q9Y546 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC42Q9Y546 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC42Q9Y546 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC42Q9Y546 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC42Q9Y546 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC42Q9Y546 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms