Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UTP11Q9Y3A2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UTP11Q9Y3A2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UTP11Q9Y3A2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UTP11Q9Y3A2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
UTP11Q9Y3A2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UTP11Q9Y3A2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
UTP11Q9Y3A2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UTP11Q9Y3A2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UTP11Q9Y3A2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UTP11Q9Y3A2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UTP11Q9Y3A2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UTP11Q9Y3A2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UTP11Q9Y3A2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UTP11Q9Y3A2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
UTP11Q9Y3A2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UTP11Q9Y3A2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UTP11Q9Y3A2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UTP11Q9Y3A2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UTP11Q9Y3A2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UTP11Q9Y3A2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UTP11Q9Y3A2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UTP11Q9Y3A2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UTP11Q9Y3A2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UTP11Q9Y3A2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UTP11Q9Y3A2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UTP11Q9Y3A2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UTP11Q9Y3A2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
UTP11Q9Y3A2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UTP11Q9Y3A2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
UTP11Q9Y3A2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UTP11Q9Y3A2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UTP11Q9Y3A2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UTP11Q9Y3A2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UTP11Q9Y3A2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UTP11Q9Y3A2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UTP11Q9Y3A2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UTP11Q9Y3A2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UTP11Q9Y3A2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UTP11Q9Y3A2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
UTP11Q9Y3A2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UTP11Q9Y3A2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UTP11Q9Y3A2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UTP11Q9Y3A2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UTP11Q9Y3A2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UTP11Q9Y3A2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UTP11Q9Y3A2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UTP11Q9Y3A2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UTP11Q9Y3A2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UTP11Q9Y3A2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UTP11Q9Y3A2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UTP11Q9Y3A2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UTP11Q9Y3A2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UTP11Q9Y3A2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UTP11Q9Y3A2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UTP11Q9Y3A2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
UTP11Q9Y3A2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UTP11Q9Y3A2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UTP11Q9Y3A2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UTP11Q9Y3A2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UTP11Q9Y3A2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UTP11Q9Y3A2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UTP11Q9Y3A2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UTP11Q9Y3A2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UTP11Q9Y3A2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
UTP11Q9Y3A2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UTP11Q9Y3A2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UTP11Q9Y3A2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UTP11Q9Y3A2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UTP11Q9Y3A2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UTP11Q9Y3A2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UTP11Q9Y3A2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
UTP11Q9Y3A2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UTP11Q9Y3A2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UTP11Q9Y3A2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
UTP11Q9Y3A2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UTP11Q9Y3A2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UTP11Q9Y3A2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UTP11Q9Y3A2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UTP11Q9Y3A2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UTP11Q9Y3A2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UTP11Q9Y3A2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
UTP11Q9Y3A2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UTP11Q9Y3A2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UTP11Q9Y3A2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UTP11Q9Y3A2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UTP11Q9Y3A2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UTP11Q9Y3A2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UTP11Q9Y3A2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UTP11Q9Y3A2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UTP11Q9Y3A2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UTP11Q9Y3A2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UTP11Q9Y3A2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UTP11Q9Y3A2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UTP11Q9Y3A2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UTP11Q9Y3A2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UTP11Q9Y3A2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
UTP11Q9Y3A2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UTP11Q9Y3A2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UTP11Q9Y3A2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms