Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAB39Q9Y376 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAB39Q9Y376 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CAB39Q9Y376 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAB39Q9Y376 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAB39Q9Y376 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAB39Q9Y376 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAB39Q9Y376 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAB39Q9Y376 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAB39Q9Y376 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAB39Q9Y376 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAB39Q9Y376 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAB39Q9Y376 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAB39Q9Y376 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAB39Q9Y376 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAB39Q9Y376 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAB39Q9Y376 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAB39Q9Y376 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAB39Q9Y376 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAB39Q9Y376 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAB39Q9Y376 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAB39Q9Y376 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAB39Q9Y376 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAB39Q9Y376 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CAB39Q9Y376 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAB39Q9Y376 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAB39Q9Y376 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAB39Q9Y376 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAB39Q9Y376 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAB39Q9Y376 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAB39Q9Y376 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAB39Q9Y376 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAB39Q9Y376 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAB39Q9Y376 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAB39Q9Y376 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAB39Q9Y376 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAB39Q9Y376 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAB39Q9Y376 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAB39Q9Y376 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAB39Q9Y376 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAB39Q9Y376 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAB39Q9Y376 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAB39Q9Y376 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAB39Q9Y376 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAB39Q9Y376 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAB39Q9Y376 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CAB39Q9Y376 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAB39Q9Y376 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAB39Q9Y376 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAB39Q9Y376 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAB39Q9Y376 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAB39Q9Y376 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAB39Q9Y376 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAB39Q9Y376 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAB39Q9Y376 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAB39Q9Y376 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAB39Q9Y376 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAB39Q9Y376 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAB39Q9Y376 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAB39Q9Y376 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAB39Q9Y376 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAB39Q9Y376 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAB39Q9Y376 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAB39Q9Y376 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAB39Q9Y376 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAB39Q9Y376 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAB39Q9Y376 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAB39Q9Y376 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAB39Q9Y376 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAB39Q9Y376 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAB39Q9Y376 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAB39Q9Y376 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAB39Q9Y376 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAB39Q9Y376 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAB39Q9Y376 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAB39Q9Y376 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAB39Q9Y376 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAB39Q9Y376 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAB39Q9Y376 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAB39Q9Y376 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAB39Q9Y376 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAB39Q9Y376 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CAB39Q9Y376 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CAB39Q9Y376 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAB39Q9Y376 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAB39Q9Y376 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAB39Q9Y376 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAB39Q9Y376 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CAB39Q9Y376 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAB39Q9Y376 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAB39Q9Y376 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAB39Q9Y376 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAB39Q9Y376 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAB39Q9Y376 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAB39Q9Y376 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAB39Q9Y376 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAB39Q9Y376 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAB39Q9Y376 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CAB39Q9Y376 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAB39Q9Y376 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms