Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2J0

RPH3A, Rabphilin-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPH3AQ9Y2J0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPH3AQ9Y2J0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPH3AQ9Y2J0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPH3AQ9Y2J0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPH3AQ9Y2J0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPH3AQ9Y2J0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RPH3AQ9Y2J0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RPH3AQ9Y2J0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPH3AQ9Y2J0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPH3AQ9Y2J0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPH3AQ9Y2J0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPH3AQ9Y2J0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPH3AQ9Y2J0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPH3AQ9Y2J0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPH3AQ9Y2J0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPH3AQ9Y2J0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPH3AQ9Y2J0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPH3AQ9Y2J0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPH3AQ9Y2J0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPH3AQ9Y2J0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RPH3AQ9Y2J0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPH3AQ9Y2J0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPH3AQ9Y2J0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPH3AQ9Y2J0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPH3AQ9Y2J0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPH3AQ9Y2J0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPH3AQ9Y2J0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPH3AQ9Y2J0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPH3AQ9Y2J0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RPH3AQ9Y2J0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPH3AQ9Y2J0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPH3AQ9Y2J0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPH3AQ9Y2J0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPH3AQ9Y2J0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPH3AQ9Y2J0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPH3AQ9Y2J0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPH3AQ9Y2J0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPH3AQ9Y2J0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPH3AQ9Y2J0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPH3AQ9Y2J0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPH3AQ9Y2J0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPH3AQ9Y2J0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPH3AQ9Y2J0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPH3AQ9Y2J0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPH3AQ9Y2J0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPH3AQ9Y2J0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPH3AQ9Y2J0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPH3AQ9Y2J0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPH3AQ9Y2J0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPH3AQ9Y2J0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPH3AQ9Y2J0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPH3AQ9Y2J0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPH3AQ9Y2J0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPH3AQ9Y2J0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPH3AQ9Y2J0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPH3AQ9Y2J0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPH3AQ9Y2J0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPH3AQ9Y2J0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPH3AQ9Y2J0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPH3AQ9Y2J0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPH3AQ9Y2J0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPH3AQ9Y2J0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPH3AQ9Y2J0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPH3AQ9Y2J0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPH3AQ9Y2J0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPH3AQ9Y2J0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPH3AQ9Y2J0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPH3AQ9Y2J0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPH3AQ9Y2J0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPH3AQ9Y2J0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPH3AQ9Y2J0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPH3AQ9Y2J0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPH3AQ9Y2J0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPH3AQ9Y2J0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RPH3AQ9Y2J0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPH3AQ9Y2J0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPH3AQ9Y2J0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPH3AQ9Y2J0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPH3AQ9Y2J0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPH3AQ9Y2J0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPH3AQ9Y2J0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RPH3AQ9Y2J0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPH3AQ9Y2J0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RPH3AQ9Y2J0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPH3AQ9Y2J0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPH3AQ9Y2J0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPH3AQ9Y2J0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPH3AQ9Y2J0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPH3AQ9Y2J0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPH3AQ9Y2J0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RPH3AQ9Y2J0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPH3AQ9Y2J0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPH3AQ9Y2J0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPH3AQ9Y2J0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPH3AQ9Y2J0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPH3AQ9Y2J0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPH3AQ9Y2J0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPH3AQ9Y2J0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPH3AQ9Y2J0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPH3AQ9Y2J0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms