Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ1

CNOT11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT11Q9UKZ1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNOT11Q9UKZ1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CNOT11Q9UKZ1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNOT11Q9UKZ1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNOT11Q9UKZ1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNOT11Q9UKZ1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNOT11Q9UKZ1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNOT11Q9UKZ1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CNOT11Q9UKZ1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNOT11Q9UKZ1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNOT11Q9UKZ1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNOT11Q9UKZ1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNOT11Q9UKZ1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNOT11Q9UKZ1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNOT11Q9UKZ1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNOT11Q9UKZ1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNOT11Q9UKZ1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNOT11Q9UKZ1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNOT11Q9UKZ1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNOT11Q9UKZ1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CNOT11Q9UKZ1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNOT11Q9UKZ1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNOT11Q9UKZ1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNOT11Q9UKZ1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNOT11Q9UKZ1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNOT11Q9UKZ1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNOT11Q9UKZ1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNOT11Q9UKZ1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNOT11Q9UKZ1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CNOT11Q9UKZ1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNOT11Q9UKZ1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNOT11Q9UKZ1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNOT11Q9UKZ1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNOT11Q9UKZ1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNOT11Q9UKZ1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNOT11Q9UKZ1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNOT11Q9UKZ1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNOT11Q9UKZ1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNOT11Q9UKZ1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNOT11Q9UKZ1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CNOT11Q9UKZ1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CNOT11Q9UKZ1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNOT11Q9UKZ1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNOT11Q9UKZ1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNOT11Q9UKZ1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNOT11Q9UKZ1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CNOT11Q9UKZ1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNOT11Q9UKZ1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNOT11Q9UKZ1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNOT11Q9UKZ1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNOT11Q9UKZ1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNOT11Q9UKZ1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNOT11Q9UKZ1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNOT11Q9UKZ1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNOT11Q9UKZ1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNOT11Q9UKZ1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNOT11Q9UKZ1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNOT11Q9UKZ1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNOT11Q9UKZ1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNOT11Q9UKZ1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNOT11Q9UKZ1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CNOT11Q9UKZ1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNOT11Q9UKZ1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNOT11Q9UKZ1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNOT11Q9UKZ1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNOT11Q9UKZ1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT11Q9UKZ1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT11Q9UKZ1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT11Q9UKZ1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT11Q9UKZ1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT11Q9UKZ1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT11Q9UKZ1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT11Q9UKZ1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT11Q9UKZ1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT11Q9UKZ1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT11Q9UKZ1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT11Q9UKZ1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNOT11Q9UKZ1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNOT11Q9UKZ1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNOT11Q9UKZ1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNOT11Q9UKZ1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNOT11Q9UKZ1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNOT11Q9UKZ1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNOT11Q9UKZ1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNOT11Q9UKZ1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNOT11Q9UKZ1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNOT11Q9UKZ1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNOT11Q9UKZ1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNOT11Q9UKZ1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNOT11Q9UKZ1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNOT11Q9UKZ1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNOT11Q9UKZ1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNOT11Q9UKZ1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNOT11Q9UKZ1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CNOT11Q9UKZ1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNOT11Q9UKZ1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNOT11Q9UKZ1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNOT11Q9UKZ1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNOT11Q9UKZ1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNOT11Q9UKZ1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms