Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKY0

PRND, Prion-like protein doppel, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRNDQ9UKY0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRNDQ9UKY0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRNDQ9UKY0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRNDQ9UKY0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRNDQ9UKY0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRNDQ9UKY0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRNDQ9UKY0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRNDQ9UKY0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRNDQ9UKY0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRNDQ9UKY0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRNDQ9UKY0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRNDQ9UKY0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRNDQ9UKY0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRNDQ9UKY0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRNDQ9UKY0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRNDQ9UKY0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRNDQ9UKY0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRNDQ9UKY0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRNDQ9UKY0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRNDQ9UKY0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRNDQ9UKY0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRNDQ9UKY0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRNDQ9UKY0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRNDQ9UKY0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRNDQ9UKY0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRNDQ9UKY0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRNDQ9UKY0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRNDQ9UKY0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRNDQ9UKY0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRNDQ9UKY0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRNDQ9UKY0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRNDQ9UKY0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRNDQ9UKY0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRNDQ9UKY0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRNDQ9UKY0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRNDQ9UKY0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRNDQ9UKY0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRNDQ9UKY0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRNDQ9UKY0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRNDQ9UKY0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRNDQ9UKY0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRNDQ9UKY0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRNDQ9UKY0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRNDQ9UKY0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRNDQ9UKY0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRNDQ9UKY0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRNDQ9UKY0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRNDQ9UKY0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRNDQ9UKY0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRNDQ9UKY0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRNDQ9UKY0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRNDQ9UKY0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRNDQ9UKY0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRNDQ9UKY0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRNDQ9UKY0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRNDQ9UKY0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PRNDQ9UKY0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRNDQ9UKY0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRNDQ9UKY0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRNDQ9UKY0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRNDQ9UKY0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRNDQ9UKY0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRNDQ9UKY0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRNDQ9UKY0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PRNDQ9UKY0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRNDQ9UKY0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRNDQ9UKY0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRNDQ9UKY0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRNDQ9UKY0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRNDQ9UKY0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRNDQ9UKY0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRNDQ9UKY0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRNDQ9UKY0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRNDQ9UKY0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRNDQ9UKY0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRNDQ9UKY0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRNDQ9UKY0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PRNDQ9UKY0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PRNDQ9UKY0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PRNDQ9UKY0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRNDQ9UKY0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRNDQ9UKY0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRNDQ9UKY0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRNDQ9UKY0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRNDQ9UKY0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRNDQ9UKY0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRNDQ9UKY0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRNDQ9UKY0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PRNDQ9UKY0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PRNDQ9UKY0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRNDQ9UKY0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PRNDQ9UKY0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PRNDQ9UKY0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PRNDQ9UKY0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PRNDQ9UKY0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRNDQ9UKY0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRNDQ9UKY0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PRNDQ9UKY0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRNDQ9UKY0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRNDQ9UKY0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms