Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CCNL1Q9UK58 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CCNL1Q9UK58 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CCNL1Q9UK58 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CCNL1Q9UK58 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CCNL1Q9UK58 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CCNL1Q9UK58 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CCNL1Q9UK58 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CCNL1Q9UK58 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CCNL1Q9UK58 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CCNL1Q9UK58 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCNL1Q9UK58 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCNL1Q9UK58 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCNL1Q9UK58 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCNL1Q9UK58 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCNL1Q9UK58 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCNL1Q9UK58 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCNL1Q9UK58 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCNL1Q9UK58 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCNL1Q9UK58 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCNL1Q9UK58 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCNL1Q9UK58 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCNL1Q9UK58 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
CCNL1Q9UK58 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCNL1Q9UK58 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCNL1Q9UK58 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCNL1Q9UK58 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCNL1Q9UK58 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CCNL1Q9UK58 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CCNL1Q9UK58 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CCNL1Q9UK58 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCNL1Q9UK58 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCNL1Q9UK58 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCNL1Q9UK58 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCNL1Q9UK58 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCNL1Q9UK58 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCNL1Q9UK58 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CCNL1Q9UK58 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CCNL1Q9UK58 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CCNL1Q9UK58 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CCNL1Q9UK58 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCNL1Q9UK58 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
CCNL1Q9UK58 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCNL1Q9UK58 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCNL1Q9UK58 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCNL1Q9UK58 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CCNL1Q9UK58 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CCNL1Q9UK58 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CCNL1Q9UK58 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
CCNL1Q9UK58 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CCNL1Q9UK58 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCNL1Q9UK58 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCNL1Q9UK58 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCNL1Q9UK58 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCNL1Q9UK58 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCNL1Q9UK58 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
CCNL1Q9UK58 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCNL1Q9UK58 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCNL1Q9UK58 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCNL1Q9UK58 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCNL1Q9UK58 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCNL1Q9UK58 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCNL1Q9UK58 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCNL1Q9UK58 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
CCNL1Q9UK58 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
CCNL1Q9UK58 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCNL1Q9UK58 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCNL1Q9UK58 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCNL1Q9UK58 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCNL1Q9UK58 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCNL1Q9UK58 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCNL1Q9UK58 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
CCNL1Q9UK58 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCNL1Q9UK58 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
CCNL1Q9UK58 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CCNL1Q9UK58 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CCNL1Q9UK58 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CCNL1Q9UK58 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CCNL1Q9UK58 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CCNL1Q9UK58 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
CCNL1Q9UK58 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CCNL1Q9UK58 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CCNL1Q9UK58 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CCNL1Q9UK58 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CCNL1Q9UK58 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CCNL1Q9UK58 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CCNL1Q9UK58 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CCNL1Q9UK58 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CCNL1Q9UK58 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
CCNL1Q9UK58 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CCNL1Q9UK58 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
CCNL1Q9UK58 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CCNL1Q9UK58 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CCNL1Q9UK58 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CCNL1Q9UK58 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
CCNL1Q9UK58 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
CCNL1Q9UK58 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CCNL1Q9UK58 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCNL1Q9UK58 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
CCNL1Q9UK58 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms