Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CALCOCO1Q9P1Z2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CALCOCO1Q9P1Z2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CALCOCO1Q9P1Z2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CALCOCO1Q9P1Z2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CALCOCO1Q9P1Z2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CALCOCO1Q9P1Z2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CALCOCO1Q9P1Z2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CALCOCO1Q9P1Z2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CALCOCO1Q9P1Z2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CALCOCO1Q9P1Z2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CALCOCO1Q9P1Z2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CALCOCO1Q9P1Z2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CALCOCO1Q9P1Z2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CALCOCO1Q9P1Z2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CALCOCO1Q9P1Z2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CALCOCO1Q9P1Z2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CALCOCO1Q9P1Z2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CALCOCO1Q9P1Z2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CALCOCO1Q9P1Z2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CALCOCO1Q9P1Z2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CALCOCO1Q9P1Z2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CALCOCO1Q9P1Z2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CALCOCO1Q9P1Z2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CALCOCO1Q9P1Z2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CALCOCO1Q9P1Z2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CALCOCO1Q9P1Z2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CALCOCO1Q9P1Z2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CALCOCO1Q9P1Z2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CALCOCO1Q9P1Z2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CALCOCO1Q9P1Z2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CALCOCO1Q9P1Z2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CALCOCO1Q9P1Z2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CALCOCO1Q9P1Z2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CALCOCO1Q9P1Z2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CALCOCO1Q9P1Z2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CALCOCO1Q9P1Z2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CALCOCO1Q9P1Z2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CALCOCO1Q9P1Z2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CALCOCO1Q9P1Z2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CALCOCO1Q9P1Z2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CALCOCO1Q9P1Z2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CALCOCO1Q9P1Z2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CALCOCO1Q9P1Z2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CALCOCO1Q9P1Z2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CALCOCO1Q9P1Z2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CALCOCO1Q9P1Z2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CALCOCO1Q9P1Z2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CALCOCO1Q9P1Z2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CALCOCO1Q9P1Z2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CALCOCO1Q9P1Z2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CALCOCO1Q9P1Z2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CALCOCO1Q9P1Z2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CALCOCO1Q9P1Z2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CALCOCO1Q9P1Z2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CALCOCO1Q9P1Z2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CALCOCO1Q9P1Z2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CALCOCO1Q9P1Z2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CALCOCO1Q9P1Z2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CALCOCO1Q9P1Z2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CALCOCO1Q9P1Z2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CALCOCO1Q9P1Z2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CALCOCO1Q9P1Z2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CALCOCO1Q9P1Z2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CALCOCO1Q9P1Z2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CALCOCO1Q9P1Z2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CALCOCO1Q9P1Z2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CALCOCO1Q9P1Z2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CALCOCO1Q9P1Z2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CALCOCO1Q9P1Z2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CALCOCO1Q9P1Z2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CALCOCO1Q9P1Z2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CALCOCO1Q9P1Z2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CALCOCO1Q9P1Z2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CALCOCO1Q9P1Z2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CALCOCO1Q9P1Z2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CALCOCO1Q9P1Z2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CALCOCO1Q9P1Z2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CALCOCO1Q9P1Z2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CALCOCO1Q9P1Z2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CALCOCO1Q9P1Z2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CALCOCO1Q9P1Z2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CALCOCO1Q9P1Z2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CALCOCO1Q9P1Z2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CALCOCO1Q9P1Z2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CALCOCO1Q9P1Z2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CALCOCO1Q9P1Z2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CALCOCO1Q9P1Z2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CALCOCO1Q9P1Z2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms