Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1A2

PPP4R1L, Putative serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R1LQ9P1A2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP4R1LQ9P1A2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP4R1LQ9P1A2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP4R1LQ9P1A2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP4R1LQ9P1A2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP4R1LQ9P1A2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP4R1LQ9P1A2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP4R1LQ9P1A2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP4R1LQ9P1A2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP4R1LQ9P1A2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP4R1LQ9P1A2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP4R1LQ9P1A2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPP4R1LQ9P1A2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPP4R1LQ9P1A2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPP4R1LQ9P1A2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPP4R1LQ9P1A2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPP4R1LQ9P1A2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPP4R1LQ9P1A2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPP4R1LQ9P1A2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPP4R1LQ9P1A2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPP4R1LQ9P1A2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP4R1LQ9P1A2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP4R1LQ9P1A2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP4R1LQ9P1A2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP4R1LQ9P1A2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP4R1LQ9P1A2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP4R1LQ9P1A2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PPP4R1LQ9P1A2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PPP4R1LQ9P1A2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PPP4R1LQ9P1A2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PPP4R1LQ9P1A2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPP4R1LQ9P1A2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PPP4R1LQ9P1A2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PPP4R1LQ9P1A2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPP4R1LQ9P1A2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP4R1LQ9P1A2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP4R1LQ9P1A2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP4R1LQ9P1A2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP4R1LQ9P1A2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP4R1LQ9P1A2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP4R1LQ9P1A2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP4R1LQ9P1A2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP4R1LQ9P1A2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP4R1LQ9P1A2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP4R1LQ9P1A2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP4R1LQ9P1A2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP4R1LQ9P1A2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP4R1LQ9P1A2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP4R1LQ9P1A2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP4R1LQ9P1A2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP4R1LQ9P1A2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP4R1LQ9P1A2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP4R1LQ9P1A2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP4R1LQ9P1A2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP4R1LQ9P1A2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP4R1LQ9P1A2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP4R1LQ9P1A2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP4R1LQ9P1A2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP4R1LQ9P1A2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP4R1LQ9P1A2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP4R1LQ9P1A2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP4R1LQ9P1A2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP4R1LQ9P1A2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP4R1LQ9P1A2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP4R1LQ9P1A2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP4R1LQ9P1A2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP4R1LQ9P1A2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP4R1LQ9P1A2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP4R1LQ9P1A2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP4R1LQ9P1A2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP4R1LQ9P1A2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP4R1LQ9P1A2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP4R1LQ9P1A2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP4R1LQ9P1A2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP4R1LQ9P1A2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP4R1LQ9P1A2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP4R1LQ9P1A2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP4R1LQ9P1A2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP4R1LQ9P1A2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP4R1LQ9P1A2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP4R1LQ9P1A2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP4R1LQ9P1A2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP4R1LQ9P1A2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP4R1LQ9P1A2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP4R1LQ9P1A2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP4R1LQ9P1A2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPP4R1LQ9P1A2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPP4R1LQ9P1A2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP4R1LQ9P1A2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP4R1LQ9P1A2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP4R1LQ9P1A2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP4R1LQ9P1A2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP4R1LQ9P1A2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP4R1LQ9P1A2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP4R1LQ9P1A2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP4R1LQ9P1A2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP4R1LQ9P1A2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP4R1LQ9P1A2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP4R1LQ9P1A2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP4R1LQ9P1A2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms