Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM5

NOP53, Ribosome biogenesis protein NOP53, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP53Q9NZM5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NOP53Q9NZM5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOP53Q9NZM5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOP53Q9NZM5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOP53Q9NZM5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOP53Q9NZM5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOP53Q9NZM5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NOP53Q9NZM5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOP53Q9NZM5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOP53Q9NZM5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOP53Q9NZM5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NOP53Q9NZM5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOP53Q9NZM5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOP53Q9NZM5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOP53Q9NZM5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOP53Q9NZM5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOP53Q9NZM5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOP53Q9NZM5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOP53Q9NZM5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOP53Q9NZM5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOP53Q9NZM5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NOP53Q9NZM5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NOP53Q9NZM5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NOP53Q9NZM5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOP53Q9NZM5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOP53Q9NZM5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOP53Q9NZM5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOP53Q9NZM5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOP53Q9NZM5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOP53Q9NZM5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOP53Q9NZM5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOP53Q9NZM5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOP53Q9NZM5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOP53Q9NZM5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NOP53Q9NZM5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NOP53Q9NZM5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NOP53Q9NZM5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NOP53Q9NZM5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NOP53Q9NZM5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NOP53Q9NZM5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NOP53Q9NZM5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NOP53Q9NZM5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NOP53Q9NZM5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NOP53Q9NZM5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NOP53Q9NZM5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NOP53Q9NZM5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NOP53Q9NZM5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NOP53Q9NZM5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NOP53Q9NZM5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NOP53Q9NZM5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NOP53Q9NZM5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NOP53Q9NZM5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NOP53Q9NZM5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NOP53Q9NZM5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NOP53Q9NZM5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NOP53Q9NZM5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NOP53Q9NZM5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NOP53Q9NZM5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NOP53Q9NZM5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NOP53Q9NZM5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NOP53Q9NZM5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOP53Q9NZM5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOP53Q9NZM5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOP53Q9NZM5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOP53Q9NZM5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOP53Q9NZM5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOP53Q9NZM5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOP53Q9NZM5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NOP53Q9NZM5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NOP53Q9NZM5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NOP53Q9NZM5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NOP53Q9NZM5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NOP53Q9NZM5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NOP53Q9NZM5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NOP53Q9NZM5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NOP53Q9NZM5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NOP53Q9NZM5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NOP53Q9NZM5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NOP53Q9NZM5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NOP53Q9NZM5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NOP53Q9NZM5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NOP53Q9NZM5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NOP53Q9NZM5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NOP53Q9NZM5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NOP53Q9NZM5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NOP53Q9NZM5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NOP53Q9NZM5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NOP53Q9NZM5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NOP53Q9NZM5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NOP53Q9NZM5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NOP53Q9NZM5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOP53Q9NZM5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NOP53Q9NZM5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOP53Q9NZM5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOP53Q9NZM5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOP53Q9NZM5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOP53Q9NZM5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOP53Q9NZM5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NOP53Q9NZM5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOP53Q9NZM5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms