Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSD3Q9NYI0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSD3Q9NYI0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSD3Q9NYI0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSD3Q9NYI0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSD3Q9NYI0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PSD3Q9NYI0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSD3Q9NYI0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSD3Q9NYI0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PSD3Q9NYI0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSD3Q9NYI0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSD3Q9NYI0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSD3Q9NYI0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSD3Q9NYI0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSD3Q9NYI0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PSD3Q9NYI0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PSD3Q9NYI0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSD3Q9NYI0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSD3Q9NYI0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSD3Q9NYI0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSD3Q9NYI0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSD3Q9NYI0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSD3Q9NYI0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSD3Q9NYI0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSD3Q9NYI0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSD3Q9NYI0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSD3Q9NYI0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSD3Q9NYI0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSD3Q9NYI0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSD3Q9NYI0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PSD3Q9NYI0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSD3Q9NYI0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSD3Q9NYI0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PSD3Q9NYI0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSD3Q9NYI0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSD3Q9NYI0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PSD3Q9NYI0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSD3Q9NYI0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSD3Q9NYI0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSD3Q9NYI0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSD3Q9NYI0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSD3Q9NYI0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSD3Q9NYI0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSD3Q9NYI0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PSD3Q9NYI0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSD3Q9NYI0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSD3Q9NYI0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSD3Q9NYI0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSD3Q9NYI0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSD3Q9NYI0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSD3Q9NYI0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSD3Q9NYI0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSD3Q9NYI0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSD3Q9NYI0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSD3Q9NYI0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PSD3Q9NYI0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSD3Q9NYI0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSD3Q9NYI0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSD3Q9NYI0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSD3Q9NYI0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSD3Q9NYI0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSD3Q9NYI0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSD3Q9NYI0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSD3Q9NYI0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSD3Q9NYI0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSD3Q9NYI0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSD3Q9NYI0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PSD3Q9NYI0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSD3Q9NYI0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSD3Q9NYI0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSD3Q9NYI0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSD3Q9NYI0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSD3Q9NYI0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSD3Q9NYI0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSD3Q9NYI0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSD3Q9NYI0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSD3Q9NYI0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSD3Q9NYI0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSD3Q9NYI0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSD3Q9NYI0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSD3Q9NYI0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSD3Q9NYI0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSD3Q9NYI0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSD3Q9NYI0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSD3Q9NYI0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSD3Q9NYI0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSD3Q9NYI0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSD3Q9NYI0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PSD3Q9NYI0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSD3Q9NYI0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSD3Q9NYI0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSD3Q9NYI0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSD3Q9NYI0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSD3Q9NYI0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSD3Q9NYI0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSD3Q9NYI0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSD3Q9NYI0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSD3Q9NYI0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PSD3Q9NYI0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PSD3Q9NYI0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms