Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS25

SPANXB1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXB1Q9NS25 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPANXB1Q9NS25 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPANXB1Q9NS25 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPANXB1Q9NS25 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPANXB1Q9NS25 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPANXB1Q9NS25 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPANXB1Q9NS25 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SPANXB1Q9NS25 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPANXB1Q9NS25 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPANXB1Q9NS25 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPANXB1Q9NS25 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPANXB1Q9NS25 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPANXB1Q9NS25 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPANXB1Q9NS25 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPANXB1Q9NS25 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPANXB1Q9NS25 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPANXB1Q9NS25 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPANXB1Q9NS25 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPANXB1Q9NS25 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPANXB1Q9NS25 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPANXB1Q9NS25 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPANXB1Q9NS25 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPANXB1Q9NS25 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPANXB1Q9NS25 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPANXB1Q9NS25 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPANXB1Q9NS25 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPANXB1Q9NS25 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPANXB1Q9NS25 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPANXB1Q9NS25 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPANXB1Q9NS25 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPANXB1Q9NS25 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPANXB1Q9NS25 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPANXB1Q9NS25 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPANXB1Q9NS25 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPANXB1Q9NS25 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPANXB1Q9NS25 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPANXB1Q9NS25 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPANXB1Q9NS25 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPANXB1Q9NS25 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPANXB1Q9NS25 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPANXB1Q9NS25 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SPANXB1Q9NS25 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPANXB1Q9NS25 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPANXB1Q9NS25 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPANXB1Q9NS25 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPANXB1Q9NS25 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPANXB1Q9NS25 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPANXB1Q9NS25 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPANXB1Q9NS25 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPANXB1Q9NS25 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPANXB1Q9NS25 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SPANXB1Q9NS25 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPANXB1Q9NS25 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPANXB1Q9NS25 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPANXB1Q9NS25 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPANXB1Q9NS25 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPANXB1Q9NS25 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPANXB1Q9NS25 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPANXB1Q9NS25 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPANXB1Q9NS25 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPANXB1Q9NS25 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPANXB1Q9NS25 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPANXB1Q9NS25 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPANXB1Q9NS25 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPANXB1Q9NS25 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPANXB1Q9NS25 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPANXB1Q9NS25 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPANXB1Q9NS25 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPANXB1Q9NS25 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPANXB1Q9NS25 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPANXB1Q9NS25 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPANXB1Q9NS25 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SPANXB1Q9NS25 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPANXB1Q9NS25 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPANXB1Q9NS25 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPANXB1Q9NS25 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPANXB1Q9NS25 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPANXB1Q9NS25 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPANXB1Q9NS25 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPANXB1Q9NS25 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPANXB1Q9NS25 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SPANXB1Q9NS25 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPANXB1Q9NS25 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPANXB1Q9NS25 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPANXB1Q9NS25 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPANXB1Q9NS25 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPANXB1Q9NS25 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPANXB1Q9NS25 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPANXB1Q9NS25 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPANXB1Q9NS25 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPANXB1Q9NS25 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPANXB1Q9NS25 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPANXB1Q9NS25 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPANXB1Q9NS25 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPANXB1Q9NS25 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPANXB1Q9NS25 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPANXB1Q9NS25 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPANXB1Q9NS25 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPANXB1Q9NS25 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SPANXB1Q9NS25 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms