Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE1

MMP26, Matrix metalloproteinase-26, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP26Q9NRE1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP26Q9NRE1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP26Q9NRE1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP26Q9NRE1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP26Q9NRE1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP26Q9NRE1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP26Q9NRE1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP26Q9NRE1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP26Q9NRE1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP26Q9NRE1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP26Q9NRE1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP26Q9NRE1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP26Q9NRE1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP26Q9NRE1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP26Q9NRE1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP26Q9NRE1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP26Q9NRE1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MMP26Q9NRE1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MMP26Q9NRE1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MMP26Q9NRE1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MMP26Q9NRE1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MMP26Q9NRE1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MMP26Q9NRE1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MMP26Q9NRE1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MMP26Q9NRE1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MMP26Q9NRE1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MMP26Q9NRE1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MMP26Q9NRE1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MMP26Q9NRE1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MMP26Q9NRE1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MMP26Q9NRE1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MMP26Q9NRE1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MMP26Q9NRE1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MMP26Q9NRE1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MMP26Q9NRE1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MMP26Q9NRE1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MMP26Q9NRE1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MMP26Q9NRE1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MMP26Q9NRE1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MMP26Q9NRE1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MMP26Q9NRE1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MMP26Q9NRE1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MMP26Q9NRE1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MMP26Q9NRE1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MMP26Q9NRE1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MMP26Q9NRE1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MMP26Q9NRE1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MMP26Q9NRE1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MMP26Q9NRE1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MMP26Q9NRE1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MMP26Q9NRE1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MMP26Q9NRE1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MMP26Q9NRE1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MMP26Q9NRE1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MMP26Q9NRE1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MMP26Q9NRE1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MMP26Q9NRE1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MMP26Q9NRE1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MMP26Q9NRE1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MMP26Q9NRE1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MMP26Q9NRE1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MMP26Q9NRE1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MMP26Q9NRE1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MMP26Q9NRE1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MMP26Q9NRE1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MMP26Q9NRE1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MMP26Q9NRE1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MMP26Q9NRE1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MMP26Q9NRE1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MMP26Q9NRE1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MMP26Q9NRE1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MMP26Q9NRE1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MMP26Q9NRE1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MMP26Q9NRE1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MMP26Q9NRE1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MMP26Q9NRE1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MMP26Q9NRE1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MMP26Q9NRE1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MMP26Q9NRE1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MMP26Q9NRE1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MMP26Q9NRE1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MMP26Q9NRE1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MMP26Q9NRE1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MMP26Q9NRE1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MMP26Q9NRE1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MMP26Q9NRE1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MMP26Q9NRE1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MMP26Q9NRE1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MMP26Q9NRE1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
MMP26Q9NRE1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
MMP26Q9NRE1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MMP26Q9NRE1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MMP26Q9NRE1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MMP26Q9NRE1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MMP26Q9NRE1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MMP26Q9NRE1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MMP26Q9NRE1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MMP26Q9NRE1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MMP26Q9NRE1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MMP26Q9NRE1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms