Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9C1

VIPAS39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPAS39Q9H9C1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VIPAS39Q9H9C1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VIPAS39Q9H9C1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VIPAS39Q9H9C1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VIPAS39Q9H9C1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VIPAS39Q9H9C1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VIPAS39Q9H9C1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VIPAS39Q9H9C1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VIPAS39Q9H9C1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VIPAS39Q9H9C1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VIPAS39Q9H9C1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VIPAS39Q9H9C1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VIPAS39Q9H9C1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VIPAS39Q9H9C1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VIPAS39Q9H9C1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VIPAS39Q9H9C1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VIPAS39Q9H9C1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VIPAS39Q9H9C1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
VIPAS39Q9H9C1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VIPAS39Q9H9C1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VIPAS39Q9H9C1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VIPAS39Q9H9C1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VIPAS39Q9H9C1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VIPAS39Q9H9C1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VIPAS39Q9H9C1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VIPAS39Q9H9C1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VIPAS39Q9H9C1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VIPAS39Q9H9C1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VIPAS39Q9H9C1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VIPAS39Q9H9C1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VIPAS39Q9H9C1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VIPAS39Q9H9C1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
VIPAS39Q9H9C1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
VIPAS39Q9H9C1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VIPAS39Q9H9C1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
VIPAS39Q9H9C1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VIPAS39Q9H9C1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VIPAS39Q9H9C1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VIPAS39Q9H9C1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VIPAS39Q9H9C1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VIPAS39Q9H9C1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VIPAS39Q9H9C1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VIPAS39Q9H9C1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VIPAS39Q9H9C1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VIPAS39Q9H9C1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VIPAS39Q9H9C1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VIPAS39Q9H9C1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VIPAS39Q9H9C1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VIPAS39Q9H9C1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VIPAS39Q9H9C1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
VIPAS39Q9H9C1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VIPAS39Q9H9C1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VIPAS39Q9H9C1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VIPAS39Q9H9C1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VIPAS39Q9H9C1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VIPAS39Q9H9C1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VIPAS39Q9H9C1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VIPAS39Q9H9C1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VIPAS39Q9H9C1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
VIPAS39Q9H9C1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VIPAS39Q9H9C1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VIPAS39Q9H9C1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VIPAS39Q9H9C1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VIPAS39Q9H9C1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VIPAS39Q9H9C1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VIPAS39Q9H9C1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VIPAS39Q9H9C1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VIPAS39Q9H9C1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VIPAS39Q9H9C1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VIPAS39Q9H9C1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VIPAS39Q9H9C1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VIPAS39Q9H9C1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VIPAS39Q9H9C1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
VIPAS39Q9H9C1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
VIPAS39Q9H9C1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
VIPAS39Q9H9C1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VIPAS39Q9H9C1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VIPAS39Q9H9C1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VIPAS39Q9H9C1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VIPAS39Q9H9C1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VIPAS39Q9H9C1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VIPAS39Q9H9C1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VIPAS39Q9H9C1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VIPAS39Q9H9C1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VIPAS39Q9H9C1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VIPAS39Q9H9C1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VIPAS39Q9H9C1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VIPAS39Q9H9C1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VIPAS39Q9H9C1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VIPAS39Q9H9C1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VIPAS39Q9H9C1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VIPAS39Q9H9C1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VIPAS39Q9H9C1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VIPAS39Q9H9C1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VIPAS39Q9H9C1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VIPAS39Q9H9C1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VIPAS39Q9H9C1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VIPAS39Q9H9C1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VIPAS39Q9H9C1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VIPAS39Q9H9C1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms