Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3P2

NELFA, Negative elongation factor A, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFAQ9H3P2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NELFAQ9H3P2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NELFAQ9H3P2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NELFAQ9H3P2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NELFAQ9H3P2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NELFAQ9H3P2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NELFAQ9H3P2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NELFAQ9H3P2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NELFAQ9H3P2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NELFAQ9H3P2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NELFAQ9H3P2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NELFAQ9H3P2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NELFAQ9H3P2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NELFAQ9H3P2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NELFAQ9H3P2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NELFAQ9H3P2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NELFAQ9H3P2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NELFAQ9H3P2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NELFAQ9H3P2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NELFAQ9H3P2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NELFAQ9H3P2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NELFAQ9H3P2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NELFAQ9H3P2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NELFAQ9H3P2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NELFAQ9H3P2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NELFAQ9H3P2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NELFAQ9H3P2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NELFAQ9H3P2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NELFAQ9H3P2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NELFAQ9H3P2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NELFAQ9H3P2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NELFAQ9H3P2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NELFAQ9H3P2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NELFAQ9H3P2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NELFAQ9H3P2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NELFAQ9H3P2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NELFAQ9H3P2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NELFAQ9H3P2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NELFAQ9H3P2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NELFAQ9H3P2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NELFAQ9H3P2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NELFAQ9H3P2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NELFAQ9H3P2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NELFAQ9H3P2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NELFAQ9H3P2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NELFAQ9H3P2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NELFAQ9H3P2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NELFAQ9H3P2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NELFAQ9H3P2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NELFAQ9H3P2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NELFAQ9H3P2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NELFAQ9H3P2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NELFAQ9H3P2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NELFAQ9H3P2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NELFAQ9H3P2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NELFAQ9H3P2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NELFAQ9H3P2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NELFAQ9H3P2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NELFAQ9H3P2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NELFAQ9H3P2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NELFAQ9H3P2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NELFAQ9H3P2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NELFAQ9H3P2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NELFAQ9H3P2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NELFAQ9H3P2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NELFAQ9H3P2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NELFAQ9H3P2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NELFAQ9H3P2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NELFAQ9H3P2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NELFAQ9H3P2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NELFAQ9H3P2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NELFAQ9H3P2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NELFAQ9H3P2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NELFAQ9H3P2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NELFAQ9H3P2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NELFAQ9H3P2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NELFAQ9H3P2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NELFAQ9H3P2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NELFAQ9H3P2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NELFAQ9H3P2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NELFAQ9H3P2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NELFAQ9H3P2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NELFAQ9H3P2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NELFAQ9H3P2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NELFAQ9H3P2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NELFAQ9H3P2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NELFAQ9H3P2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NELFAQ9H3P2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NELFAQ9H3P2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NELFAQ9H3P2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NELFAQ9H3P2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NELFAQ9H3P2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NELFAQ9H3P2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NELFAQ9H3P2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NELFAQ9H3P2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NELFAQ9H3P2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NELFAQ9H3P2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NELFAQ9H3P2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NELFAQ9H3P2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NELFAQ9H3P2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms