Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3M7

TXNIP, Thioredoxin-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNIPQ9H3M7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TXNIPQ9H3M7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TXNIPQ9H3M7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TXNIPQ9H3M7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TXNIPQ9H3M7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TXNIPQ9H3M7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TXNIPQ9H3M7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TXNIPQ9H3M7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TXNIPQ9H3M7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TXNIPQ9H3M7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TXNIPQ9H3M7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TXNIPQ9H3M7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TXNIPQ9H3M7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TXNIPQ9H3M7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TXNIPQ9H3M7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TXNIPQ9H3M7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TXNIPQ9H3M7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TXNIPQ9H3M7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TXNIPQ9H3M7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TXNIPQ9H3M7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNIPQ9H3M7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNIPQ9H3M7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNIPQ9H3M7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNIPQ9H3M7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNIPQ9H3M7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNIPQ9H3M7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNIPQ9H3M7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNIPQ9H3M7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNIPQ9H3M7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNIPQ9H3M7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNIPQ9H3M7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNIPQ9H3M7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNIPQ9H3M7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNIPQ9H3M7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNIPQ9H3M7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNIPQ9H3M7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNIPQ9H3M7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNIPQ9H3M7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNIPQ9H3M7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNIPQ9H3M7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TXNIPQ9H3M7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TXNIPQ9H3M7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TXNIPQ9H3M7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TXNIPQ9H3M7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TXNIPQ9H3M7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNIPQ9H3M7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNIPQ9H3M7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNIPQ9H3M7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNIPQ9H3M7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNIPQ9H3M7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNIPQ9H3M7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNIPQ9H3M7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNIPQ9H3M7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNIPQ9H3M7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TXNIPQ9H3M7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TXNIPQ9H3M7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TXNIPQ9H3M7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TXNIPQ9H3M7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TXNIPQ9H3M7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TXNIPQ9H3M7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TXNIPQ9H3M7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TXNIPQ9H3M7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TXNIPQ9H3M7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TXNIPQ9H3M7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TXNIPQ9H3M7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TXNIPQ9H3M7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TXNIPQ9H3M7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TXNIPQ9H3M7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TXNIPQ9H3M7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TXNIPQ9H3M7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TXNIPQ9H3M7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TXNIPQ9H3M7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TXNIPQ9H3M7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TXNIPQ9H3M7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TXNIPQ9H3M7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TXNIPQ9H3M7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TXNIPQ9H3M7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TXNIPQ9H3M7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TXNIPQ9H3M7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TXNIPQ9H3M7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TXNIPQ9H3M7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TXNIPQ9H3M7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TXNIPQ9H3M7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TXNIPQ9H3M7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TXNIPQ9H3M7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TXNIPQ9H3M7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TXNIPQ9H3M7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TXNIPQ9H3M7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TXNIPQ9H3M7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TXNIPQ9H3M7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TXNIPQ9H3M7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TXNIPQ9H3M7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TXNIPQ9H3M7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TXNIPQ9H3M7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TXNIPQ9H3M7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TXNIPQ9H3M7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TXNIPQ9H3M7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TXNIPQ9H3M7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TXNIPQ9H3M7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TXNIPQ9H3M7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms