Protein–RNA interactions for Protein: Q9H015

SLC22A4, Solute carrier family 22 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A4Q9H015 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC22A4Q9H015 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC22A4Q9H015 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC22A4Q9H015 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC22A4Q9H015 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC22A4Q9H015 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC22A4Q9H015 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC22A4Q9H015 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC22A4Q9H015 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC22A4Q9H015 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC22A4Q9H015 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC22A4Q9H015 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC22A4Q9H015 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC22A4Q9H015 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC22A4Q9H015 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC22A4Q9H015 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC22A4Q9H015 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC22A4Q9H015 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC22A4Q9H015 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC22A4Q9H015 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC22A4Q9H015 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC22A4Q9H015 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC22A4Q9H015 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC22A4Q9H015 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC22A4Q9H015 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC22A4Q9H015 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC22A4Q9H015 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC22A4Q9H015 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC22A4Q9H015 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC22A4Q9H015 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC22A4Q9H015 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC22A4Q9H015 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC22A4Q9H015 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC22A4Q9H015 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC22A4Q9H015 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC22A4Q9H015 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC22A4Q9H015 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC22A4Q9H015 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC22A4Q9H015 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC22A4Q9H015 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC22A4Q9H015 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC22A4Q9H015 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC22A4Q9H015 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC22A4Q9H015 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC22A4Q9H015 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC22A4Q9H015 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC22A4Q9H015 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC22A4Q9H015 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC22A4Q9H015 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC22A4Q9H015 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC22A4Q9H015 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC22A4Q9H015 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC22A4Q9H015 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC22A4Q9H015 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC22A4Q9H015 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC22A4Q9H015 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC22A4Q9H015 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC22A4Q9H015 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC22A4Q9H015 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC22A4Q9H015 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC22A4Q9H015 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC22A4Q9H015 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC22A4Q9H015 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC22A4Q9H015 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC22A4Q9H015 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC22A4Q9H015 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC22A4Q9H015 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC22A4Q9H015 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC22A4Q9H015 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC22A4Q9H015 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC22A4Q9H015 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC22A4Q9H015 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC22A4Q9H015 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC22A4Q9H015 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC22A4Q9H015 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC22A4Q9H015 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC22A4Q9H015 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC22A4Q9H015 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC22A4Q9H015 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC22A4Q9H015 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC22A4Q9H015 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC22A4Q9H015 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC22A4Q9H015 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC22A4Q9H015 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC22A4Q9H015 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC22A4Q9H015 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC22A4Q9H015 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC22A4Q9H015 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A4Q9H015 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A4Q9H015 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A4Q9H015 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A4Q9H015 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A4Q9H015 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC22A4Q9H015 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC22A4Q9H015 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC22A4Q9H015 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC22A4Q9H015 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC22A4Q9H015 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC22A4Q9H015 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC22A4Q9H015 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms