Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BHLHE41Q9C0J9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BHLHE41Q9C0J9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BHLHE41Q9C0J9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BHLHE41Q9C0J9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BHLHE41Q9C0J9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BHLHE41Q9C0J9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BHLHE41Q9C0J9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BHLHE41Q9C0J9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BHLHE41Q9C0J9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BHLHE41Q9C0J9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BHLHE41Q9C0J9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BHLHE41Q9C0J9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BHLHE41Q9C0J9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BHLHE41Q9C0J9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BHLHE41Q9C0J9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BHLHE41Q9C0J9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BHLHE41Q9C0J9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BHLHE41Q9C0J9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BHLHE41Q9C0J9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BHLHE41Q9C0J9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BHLHE41Q9C0J9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BHLHE41Q9C0J9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BHLHE41Q9C0J9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BHLHE41Q9C0J9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BHLHE41Q9C0J9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BHLHE41Q9C0J9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BHLHE41Q9C0J9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BHLHE41Q9C0J9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BHLHE41Q9C0J9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BHLHE41Q9C0J9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BHLHE41Q9C0J9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BHLHE41Q9C0J9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BHLHE41Q9C0J9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
BHLHE41Q9C0J9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BHLHE41Q9C0J9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BHLHE41Q9C0J9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BHLHE41Q9C0J9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BHLHE41Q9C0J9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BHLHE41Q9C0J9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
BHLHE41Q9C0J9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BHLHE41Q9C0J9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BHLHE41Q9C0J9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BHLHE41Q9C0J9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BHLHE41Q9C0J9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BHLHE41Q9C0J9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BHLHE41Q9C0J9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BHLHE41Q9C0J9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BHLHE41Q9C0J9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BHLHE41Q9C0J9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BHLHE41Q9C0J9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BHLHE41Q9C0J9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BHLHE41Q9C0J9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BHLHE41Q9C0J9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BHLHE41Q9C0J9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BHLHE41Q9C0J9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BHLHE41Q9C0J9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BHLHE41Q9C0J9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BHLHE41Q9C0J9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BHLHE41Q9C0J9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BHLHE41Q9C0J9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BHLHE41Q9C0J9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BHLHE41Q9C0J9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BHLHE41Q9C0J9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BHLHE41Q9C0J9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BHLHE41Q9C0J9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BHLHE41Q9C0J9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BHLHE41Q9C0J9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BHLHE41Q9C0J9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BHLHE41Q9C0J9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BHLHE41Q9C0J9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BHLHE41Q9C0J9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BHLHE41Q9C0J9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BHLHE41Q9C0J9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BHLHE41Q9C0J9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BHLHE41Q9C0J9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BHLHE41Q9C0J9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BHLHE41Q9C0J9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BHLHE41Q9C0J9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BHLHE41Q9C0J9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BHLHE41Q9C0J9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BHLHE41Q9C0J9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BHLHE41Q9C0J9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BHLHE41Q9C0J9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BHLHE41Q9C0J9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BHLHE41Q9C0J9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BHLHE41Q9C0J9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BHLHE41Q9C0J9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BHLHE41Q9C0J9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BHLHE41Q9C0J9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BHLHE41Q9C0J9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BHLHE41Q9C0J9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BHLHE41Q9C0J9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BHLHE41Q9C0J9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BHLHE41Q9C0J9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BHLHE41Q9C0J9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BHLHE41Q9C0J9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BHLHE41Q9C0J9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms