Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXR3

ERVK-6, Endogenous retrovirus group K member 6 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-6Q9BXR3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVK-6Q9BXR3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVK-6Q9BXR3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVK-6Q9BXR3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVK-6Q9BXR3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVK-6Q9BXR3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVK-6Q9BXR3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVK-6Q9BXR3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVK-6Q9BXR3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVK-6Q9BXR3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ERVK-6Q9BXR3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ERVK-6Q9BXR3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ERVK-6Q9BXR3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ERVK-6Q9BXR3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVK-6Q9BXR3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVK-6Q9BXR3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVK-6Q9BXR3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVK-6Q9BXR3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVK-6Q9BXR3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVK-6Q9BXR3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVK-6Q9BXR3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVK-6Q9BXR3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVK-6Q9BXR3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVK-6Q9BXR3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVK-6Q9BXR3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVK-6Q9BXR3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVK-6Q9BXR3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVK-6Q9BXR3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVK-6Q9BXR3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVK-6Q9BXR3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVK-6Q9BXR3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVK-6Q9BXR3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVK-6Q9BXR3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVK-6Q9BXR3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVK-6Q9BXR3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVK-6Q9BXR3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVK-6Q9BXR3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
ERVK-6Q9BXR3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVK-6Q9BXR3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVK-6Q9BXR3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVK-6Q9BXR3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVK-6Q9BXR3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVK-6Q9BXR3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVK-6Q9BXR3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-6Q9BXR3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-6Q9BXR3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-6Q9BXR3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-6Q9BXR3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-6Q9BXR3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-6Q9BXR3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-6Q9BXR3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-6Q9BXR3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-6Q9BXR3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVK-6Q9BXR3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVK-6Q9BXR3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVK-6Q9BXR3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVK-6Q9BXR3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVK-6Q9BXR3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVK-6Q9BXR3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVK-6Q9BXR3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVK-6Q9BXR3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVK-6Q9BXR3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVK-6Q9BXR3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVK-6Q9BXR3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVK-6Q9BXR3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVK-6Q9BXR3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVK-6Q9BXR3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVK-6Q9BXR3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVK-6Q9BXR3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVK-6Q9BXR3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ERVK-6Q9BXR3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVK-6Q9BXR3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVK-6Q9BXR3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVK-6Q9BXR3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVK-6Q9BXR3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVK-6Q9BXR3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVK-6Q9BXR3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVK-6Q9BXR3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVK-6Q9BXR3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVK-6Q9BXR3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVK-6Q9BXR3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVK-6Q9BXR3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVK-6Q9BXR3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVK-6Q9BXR3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVK-6Q9BXR3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVK-6Q9BXR3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVK-6Q9BXR3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVK-6Q9BXR3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVK-6Q9BXR3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVK-6Q9BXR3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVK-6Q9BXR3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVK-6Q9BXR3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVK-6Q9BXR3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVK-6Q9BXR3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERVK-6Q9BXR3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVK-6Q9BXR3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVK-6Q9BXR3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVK-6Q9BXR3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVK-6Q9BXR3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVK-6Q9BXR3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.7 ms