Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVT8

TMUB1, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB1Q9BVT8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMUB1Q9BVT8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMUB1Q9BVT8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMUB1Q9BVT8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMUB1Q9BVT8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TMUB1Q9BVT8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMUB1Q9BVT8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMUB1Q9BVT8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMUB1Q9BVT8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMUB1Q9BVT8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TMUB1Q9BVT8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMUB1Q9BVT8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMUB1Q9BVT8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TMUB1Q9BVT8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TMUB1Q9BVT8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TMUB1Q9BVT8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMUB1Q9BVT8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMUB1Q9BVT8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMUB1Q9BVT8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMUB1Q9BVT8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TMUB1Q9BVT8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMUB1Q9BVT8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMUB1Q9BVT8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TMUB1Q9BVT8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TMUB1Q9BVT8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TMUB1Q9BVT8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMUB1Q9BVT8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TMUB1Q9BVT8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMUB1Q9BVT8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMUB1Q9BVT8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMUB1Q9BVT8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMUB1Q9BVT8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMUB1Q9BVT8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMUB1Q9BVT8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMUB1Q9BVT8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMUB1Q9BVT8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMUB1Q9BVT8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMUB1Q9BVT8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMUB1Q9BVT8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMUB1Q9BVT8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMUB1Q9BVT8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TMUB1Q9BVT8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMUB1Q9BVT8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMUB1Q9BVT8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMUB1Q9BVT8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TMUB1Q9BVT8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TMUB1Q9BVT8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMUB1Q9BVT8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMUB1Q9BVT8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMUB1Q9BVT8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMUB1Q9BVT8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMUB1Q9BVT8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMUB1Q9BVT8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMUB1Q9BVT8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMUB1Q9BVT8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMUB1Q9BVT8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMUB1Q9BVT8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMUB1Q9BVT8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMUB1Q9BVT8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMUB1Q9BVT8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMUB1Q9BVT8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMUB1Q9BVT8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMUB1Q9BVT8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMUB1Q9BVT8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TMUB1Q9BVT8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TMUB1Q9BVT8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMUB1Q9BVT8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMUB1Q9BVT8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMUB1Q9BVT8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMUB1Q9BVT8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMUB1Q9BVT8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMUB1Q9BVT8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TMUB1Q9BVT8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMUB1Q9BVT8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMUB1Q9BVT8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMUB1Q9BVT8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMUB1Q9BVT8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMUB1Q9BVT8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMUB1Q9BVT8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMUB1Q9BVT8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMUB1Q9BVT8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMUB1Q9BVT8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMUB1Q9BVT8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMUB1Q9BVT8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMUB1Q9BVT8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMUB1Q9BVT8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMUB1Q9BVT8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMUB1Q9BVT8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMUB1Q9BVT8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMUB1Q9BVT8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TMUB1Q9BVT8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMUB1Q9BVT8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMUB1Q9BVT8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMUB1Q9BVT8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TMUB1Q9BVT8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMUB1Q9BVT8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMUB1Q9BVT8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMUB1Q9BVT8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMUB1Q9BVT8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TMUB1Q9BVT8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms