Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL4

SELENOO, Selenoprotein O, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOOQ9BVL4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SELENOOQ9BVL4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SELENOOQ9BVL4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SELENOOQ9BVL4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SELENOOQ9BVL4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SELENOOQ9BVL4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SELENOOQ9BVL4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SELENOOQ9BVL4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SELENOOQ9BVL4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SELENOOQ9BVL4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SELENOOQ9BVL4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SELENOOQ9BVL4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SELENOOQ9BVL4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SELENOOQ9BVL4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SELENOOQ9BVL4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SELENOOQ9BVL4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SELENOOQ9BVL4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SELENOOQ9BVL4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SELENOOQ9BVL4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SELENOOQ9BVL4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SELENOOQ9BVL4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SELENOOQ9BVL4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SELENOOQ9BVL4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SELENOOQ9BVL4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SELENOOQ9BVL4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SELENOOQ9BVL4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SELENOOQ9BVL4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SELENOOQ9BVL4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SELENOOQ9BVL4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SELENOOQ9BVL4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SELENOOQ9BVL4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SELENOOQ9BVL4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SELENOOQ9BVL4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SELENOOQ9BVL4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SELENOOQ9BVL4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SELENOOQ9BVL4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SELENOOQ9BVL4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SELENOOQ9BVL4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SELENOOQ9BVL4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SELENOOQ9BVL4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SELENOOQ9BVL4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SELENOOQ9BVL4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SELENOOQ9BVL4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SELENOOQ9BVL4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SELENOOQ9BVL4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SELENOOQ9BVL4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SELENOOQ9BVL4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SELENOOQ9BVL4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SELENOOQ9BVL4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SELENOOQ9BVL4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SELENOOQ9BVL4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SELENOOQ9BVL4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SELENOOQ9BVL4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SELENOOQ9BVL4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SELENOOQ9BVL4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SELENOOQ9BVL4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SELENOOQ9BVL4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SELENOOQ9BVL4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SELENOOQ9BVL4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SELENOOQ9BVL4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SELENOOQ9BVL4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SELENOOQ9BVL4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SELENOOQ9BVL4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SELENOOQ9BVL4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SELENOOQ9BVL4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SELENOOQ9BVL4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SELENOOQ9BVL4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SELENOOQ9BVL4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SELENOOQ9BVL4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SELENOOQ9BVL4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SELENOOQ9BVL4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SELENOOQ9BVL4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SELENOOQ9BVL4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SELENOOQ9BVL4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SELENOOQ9BVL4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SELENOOQ9BVL4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SELENOOQ9BVL4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SELENOOQ9BVL4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SELENOOQ9BVL4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SELENOOQ9BVL4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SELENOOQ9BVL4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SELENOOQ9BVL4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SELENOOQ9BVL4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SELENOOQ9BVL4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SELENOOQ9BVL4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SELENOOQ9BVL4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SELENOOQ9BVL4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SELENOOQ9BVL4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SELENOOQ9BVL4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SELENOOQ9BVL4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SELENOOQ9BVL4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SELENOOQ9BVL4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SELENOOQ9BVL4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SELENOOQ9BVL4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SELENOOQ9BVL4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SELENOOQ9BVL4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SELENOOQ9BVL4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SELENOOQ9BVL4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SELENOOQ9BVL4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SELENOOQ9BVL4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms