Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS31

ZNF649, Zinc finger protein 649, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF649Q9BS31 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF649Q9BS31 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF649Q9BS31 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF649Q9BS31 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF649Q9BS31 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF649Q9BS31 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF649Q9BS31 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF649Q9BS31 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF649Q9BS31 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF649Q9BS31 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF649Q9BS31 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF649Q9BS31 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF649Q9BS31 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF649Q9BS31 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF649Q9BS31 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF649Q9BS31 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF649Q9BS31 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF649Q9BS31 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF649Q9BS31 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF649Q9BS31 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF649Q9BS31 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF649Q9BS31 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF649Q9BS31 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF649Q9BS31 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF649Q9BS31 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF649Q9BS31 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF649Q9BS31 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF649Q9BS31 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF649Q9BS31 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF649Q9BS31 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF649Q9BS31 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF649Q9BS31 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF649Q9BS31 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF649Q9BS31 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF649Q9BS31 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF649Q9BS31 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF649Q9BS31 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF649Q9BS31 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF649Q9BS31 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF649Q9BS31 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF649Q9BS31 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF649Q9BS31 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF649Q9BS31 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF649Q9BS31 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF649Q9BS31 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF649Q9BS31 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF649Q9BS31 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF649Q9BS31 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF649Q9BS31 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF649Q9BS31 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF649Q9BS31 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF649Q9BS31 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF649Q9BS31 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF649Q9BS31 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF649Q9BS31 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF649Q9BS31 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF649Q9BS31 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF649Q9BS31 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF649Q9BS31 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF649Q9BS31 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF649Q9BS31 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF649Q9BS31 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF649Q9BS31 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF649Q9BS31 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF649Q9BS31 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF649Q9BS31 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF649Q9BS31 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF649Q9BS31 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF649Q9BS31 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF649Q9BS31 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF649Q9BS31 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF649Q9BS31 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF649Q9BS31 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF649Q9BS31 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF649Q9BS31 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF649Q9BS31 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF649Q9BS31 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF649Q9BS31 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF649Q9BS31 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF649Q9BS31 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF649Q9BS31 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF649Q9BS31 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF649Q9BS31 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF649Q9BS31 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF649Q9BS31 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF649Q9BS31 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF649Q9BS31 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF649Q9BS31 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF649Q9BS31 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF649Q9BS31 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF649Q9BS31 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF649Q9BS31 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF649Q9BS31 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF649Q9BS31 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF649Q9BS31 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF649Q9BS31 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF649Q9BS31 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZNF649Q9BS31 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF649Q9BS31 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF649Q9BS31 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms