Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRT9

GINS4, DNA replication complex GINS protein SLD5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS4Q9BRT9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GINS4Q9BRT9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GINS4Q9BRT9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GINS4Q9BRT9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GINS4Q9BRT9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GINS4Q9BRT9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GINS4Q9BRT9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GINS4Q9BRT9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GINS4Q9BRT9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GINS4Q9BRT9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GINS4Q9BRT9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GINS4Q9BRT9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GINS4Q9BRT9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GINS4Q9BRT9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GINS4Q9BRT9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GINS4Q9BRT9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GINS4Q9BRT9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GINS4Q9BRT9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GINS4Q9BRT9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GINS4Q9BRT9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GINS4Q9BRT9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GINS4Q9BRT9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GINS4Q9BRT9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GINS4Q9BRT9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GINS4Q9BRT9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GINS4Q9BRT9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GINS4Q9BRT9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GINS4Q9BRT9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GINS4Q9BRT9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GINS4Q9BRT9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GINS4Q9BRT9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GINS4Q9BRT9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GINS4Q9BRT9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GINS4Q9BRT9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GINS4Q9BRT9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINS4Q9BRT9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINS4Q9BRT9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINS4Q9BRT9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINS4Q9BRT9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINS4Q9BRT9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GINS4Q9BRT9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GINS4Q9BRT9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GINS4Q9BRT9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GINS4Q9BRT9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GINS4Q9BRT9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GINS4Q9BRT9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GINS4Q9BRT9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GINS4Q9BRT9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GINS4Q9BRT9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GINS4Q9BRT9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GINS4Q9BRT9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GINS4Q9BRT9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GINS4Q9BRT9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GINS4Q9BRT9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GINS4Q9BRT9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GINS4Q9BRT9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GINS4Q9BRT9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GINS4Q9BRT9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GINS4Q9BRT9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GINS4Q9BRT9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GINS4Q9BRT9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GINS4Q9BRT9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GINS4Q9BRT9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GINS4Q9BRT9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GINS4Q9BRT9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GINS4Q9BRT9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GINS4Q9BRT9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
GINS4Q9BRT9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GINS4Q9BRT9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GINS4Q9BRT9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GINS4Q9BRT9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GINS4Q9BRT9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GINS4Q9BRT9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GINS4Q9BRT9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GINS4Q9BRT9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GINS4Q9BRT9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GINS4Q9BRT9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GINS4Q9BRT9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GINS4Q9BRT9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GINS4Q9BRT9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GINS4Q9BRT9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GINS4Q9BRT9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GINS4Q9BRT9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GINS4Q9BRT9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GINS4Q9BRT9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GINS4Q9BRT9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GINS4Q9BRT9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GINS4Q9BRT9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GINS4Q9BRT9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GINS4Q9BRT9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GINS4Q9BRT9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GINS4Q9BRT9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GINS4Q9BRT9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GINS4Q9BRT9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GINS4Q9BRT9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GINS4Q9BRT9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GINS4Q9BRT9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GINS4Q9BRT9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GINS4Q9BRT9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GINS4Q9BRT9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118 ms