Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RETNLBQ9BQ08 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RETNLBQ9BQ08 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RETNLBQ9BQ08 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RETNLBQ9BQ08 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RETNLBQ9BQ08 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RETNLBQ9BQ08 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RETNLBQ9BQ08 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RETNLBQ9BQ08 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RETNLBQ9BQ08 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RETNLBQ9BQ08 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RETNLBQ9BQ08 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RETNLBQ9BQ08 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RETNLBQ9BQ08 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RETNLBQ9BQ08 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RETNLBQ9BQ08 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RETNLBQ9BQ08 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RETNLBQ9BQ08 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RETNLBQ9BQ08 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RETNLBQ9BQ08 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RETNLBQ9BQ08 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RETNLBQ9BQ08 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RETNLBQ9BQ08 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RETNLBQ9BQ08 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RETNLBQ9BQ08 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RETNLBQ9BQ08 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RETNLBQ9BQ08 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RETNLBQ9BQ08 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RETNLBQ9BQ08 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RETNLBQ9BQ08 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RETNLBQ9BQ08 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RETNLBQ9BQ08 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RETNLBQ9BQ08 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RETNLBQ9BQ08 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RETNLBQ9BQ08 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RETNLBQ9BQ08 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RETNLBQ9BQ08 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RETNLBQ9BQ08 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RETNLBQ9BQ08 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RETNLBQ9BQ08 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RETNLBQ9BQ08 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RETNLBQ9BQ08 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RETNLBQ9BQ08 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RETNLBQ9BQ08 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RETNLBQ9BQ08 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RETNLBQ9BQ08 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RETNLBQ9BQ08 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RETNLBQ9BQ08 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RETNLBQ9BQ08 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RETNLBQ9BQ08 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RETNLBQ9BQ08 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RETNLBQ9BQ08 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RETNLBQ9BQ08 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RETNLBQ9BQ08 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RETNLBQ9BQ08 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RETNLBQ9BQ08 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RETNLBQ9BQ08 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RETNLBQ9BQ08 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RETNLBQ9BQ08 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RETNLBQ9BQ08 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RETNLBQ9BQ08 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RETNLBQ9BQ08 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RETNLBQ9BQ08 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RETNLBQ9BQ08 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RETNLBQ9BQ08 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RETNLBQ9BQ08 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RETNLBQ9BQ08 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RETNLBQ9BQ08 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RETNLBQ9BQ08 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RETNLBQ9BQ08 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RETNLBQ9BQ08 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RETNLBQ9BQ08 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RETNLBQ9BQ08 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RETNLBQ9BQ08 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RETNLBQ9BQ08 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RETNLBQ9BQ08 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RETNLBQ9BQ08 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RETNLBQ9BQ08 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RETNLBQ9BQ08 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RETNLBQ9BQ08 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RETNLBQ9BQ08 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RETNLBQ9BQ08 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RETNLBQ9BQ08 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RETNLBQ9BQ08 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RETNLBQ9BQ08 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RETNLBQ9BQ08 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RETNLBQ9BQ08 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms