Protein–RNA interactions for Protein: Q99456

KRT12, Keratin, type I cytoskeletal 12, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT12Q99456 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT12Q99456 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT12Q99456 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT12Q99456 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT12Q99456 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT12Q99456 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT12Q99456 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KRT12Q99456 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT12Q99456 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT12Q99456 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT12Q99456 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT12Q99456 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT12Q99456 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT12Q99456 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT12Q99456 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT12Q99456 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT12Q99456 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT12Q99456 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT12Q99456 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT12Q99456 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT12Q99456 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT12Q99456 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT12Q99456 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT12Q99456 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT12Q99456 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT12Q99456 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT12Q99456 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT12Q99456 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT12Q99456 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT12Q99456 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT12Q99456 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT12Q99456 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT12Q99456 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT12Q99456 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT12Q99456 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT12Q99456 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT12Q99456 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT12Q99456 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KRT12Q99456 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KRT12Q99456 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
KRT12Q99456 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KRT12Q99456 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT12Q99456 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT12Q99456 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT12Q99456 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT12Q99456 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT12Q99456 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT12Q99456 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT12Q99456 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT12Q99456 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT12Q99456 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT12Q99456 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT12Q99456 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT12Q99456 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT12Q99456 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT12Q99456 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT12Q99456 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT12Q99456 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT12Q99456 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT12Q99456 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT12Q99456 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT12Q99456 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT12Q99456 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT12Q99456 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
KRT12Q99456 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT12Q99456 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT12Q99456 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT12Q99456 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT12Q99456 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT12Q99456 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT12Q99456 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT12Q99456 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT12Q99456 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT12Q99456 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT12Q99456 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT12Q99456 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT12Q99456 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT12Q99456 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT12Q99456 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT12Q99456 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT12Q99456 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT12Q99456 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT12Q99456 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT12Q99456 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT12Q99456 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT12Q99456 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT12Q99456 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT12Q99456 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT12Q99456 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT12Q99456 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT12Q99456 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT12Q99456 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT12Q99456 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT12Q99456 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT12Q99456 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT12Q99456 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT12Q99456 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT12Q99456 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT12Q99456 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT12Q99456 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms