Protein–RNA interactions for Protein: Q96T83

SLC9A7, Sodium/hydrogen exchanger 7, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A7Q96T83 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC9A7Q96T83 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC9A7Q96T83 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC9A7Q96T83 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC9A7Q96T83 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC9A7Q96T83 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC9A7Q96T83 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC9A7Q96T83 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC9A7Q96T83 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC9A7Q96T83 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC9A7Q96T83 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC9A7Q96T83 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC9A7Q96T83 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLC9A7Q96T83 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC9A7Q96T83 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC9A7Q96T83 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC9A7Q96T83 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC9A7Q96T83 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC9A7Q96T83 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC9A7Q96T83 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC9A7Q96T83 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC9A7Q96T83 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC9A7Q96T83 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC9A7Q96T83 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC9A7Q96T83 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC9A7Q96T83 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC9A7Q96T83 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC9A7Q96T83 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC9A7Q96T83 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC9A7Q96T83 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC9A7Q96T83 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC9A7Q96T83 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC9A7Q96T83 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC9A7Q96T83 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC9A7Q96T83 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC9A7Q96T83 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SLC9A7Q96T83 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC9A7Q96T83 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC9A7Q96T83 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC9A7Q96T83 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC9A7Q96T83 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SLC9A7Q96T83 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC9A7Q96T83 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC9A7Q96T83 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC9A7Q96T83 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC9A7Q96T83 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC9A7Q96T83 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC9A7Q96T83 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SLC9A7Q96T83 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC9A7Q96T83 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC9A7Q96T83 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC9A7Q96T83 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC9A7Q96T83 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SLC9A7Q96T83 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC9A7Q96T83 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SLC9A7Q96T83 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC9A7Q96T83 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
SLC9A7Q96T83 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC9A7Q96T83 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC9A7Q96T83 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC9A7Q96T83 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC9A7Q96T83 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC9A7Q96T83 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC9A7Q96T83 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC9A7Q96T83 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC9A7Q96T83 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC9A7Q96T83 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC9A7Q96T83 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC9A7Q96T83 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC9A7Q96T83 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC9A7Q96T83 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC9A7Q96T83 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC9A7Q96T83 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC9A7Q96T83 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC9A7Q96T83 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC9A7Q96T83 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC9A7Q96T83 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC9A7Q96T83 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC9A7Q96T83 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC9A7Q96T83 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC9A7Q96T83 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC9A7Q96T83 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC9A7Q96T83 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC9A7Q96T83 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC9A7Q96T83 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC9A7Q96T83 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC9A7Q96T83 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC9A7Q96T83 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC9A7Q96T83 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC9A7Q96T83 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC9A7Q96T83 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC9A7Q96T83 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC9A7Q96T83 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC9A7Q96T83 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC9A7Q96T83 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC9A7Q96T83 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC9A7Q96T83 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC9A7Q96T83 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC9A7Q96T83 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC9A7Q96T83 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms