Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX18Q96RF0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX18Q96RF0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX18Q96RF0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX18Q96RF0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX18Q96RF0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX18Q96RF0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX18Q96RF0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX18Q96RF0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX18Q96RF0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX18Q96RF0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX18Q96RF0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX18Q96RF0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX18Q96RF0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX18Q96RF0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX18Q96RF0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX18Q96RF0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX18Q96RF0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX18Q96RF0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX18Q96RF0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX18Q96RF0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX18Q96RF0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX18Q96RF0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX18Q96RF0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX18Q96RF0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX18Q96RF0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX18Q96RF0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX18Q96RF0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX18Q96RF0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX18Q96RF0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX18Q96RF0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX18Q96RF0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX18Q96RF0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX18Q96RF0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX18Q96RF0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX18Q96RF0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX18Q96RF0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX18Q96RF0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX18Q96RF0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX18Q96RF0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX18Q96RF0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX18Q96RF0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX18Q96RF0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX18Q96RF0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX18Q96RF0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX18Q96RF0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX18Q96RF0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX18Q96RF0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX18Q96RF0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX18Q96RF0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX18Q96RF0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX18Q96RF0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX18Q96RF0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX18Q96RF0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX18Q96RF0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX18Q96RF0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX18Q96RF0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX18Q96RF0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX18Q96RF0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX18Q96RF0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX18Q96RF0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX18Q96RF0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX18Q96RF0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX18Q96RF0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX18Q96RF0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX18Q96RF0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX18Q96RF0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX18Q96RF0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX18Q96RF0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX18Q96RF0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX18Q96RF0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX18Q96RF0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX18Q96RF0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX18Q96RF0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX18Q96RF0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX18Q96RF0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX18Q96RF0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX18Q96RF0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX18Q96RF0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX18Q96RF0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX18Q96RF0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX18Q96RF0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX18Q96RF0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX18Q96RF0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX18Q96RF0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX18Q96RF0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX18Q96RF0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX18Q96RF0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX18Q96RF0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX18Q96RF0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX18Q96RF0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX18Q96RF0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX18Q96RF0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX18Q96RF0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX18Q96RF0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX18Q96RF0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX18Q96RF0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX18Q96RF0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX18Q96RF0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX18Q96RF0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms