Protein–RNA interactions for Protein: Q96PG1

MS4A4E, Putative membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4E, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4EQ96PG1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A4EQ96PG1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A4EQ96PG1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A4EQ96PG1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A4EQ96PG1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A4EQ96PG1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A4EQ96PG1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A4EQ96PG1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A4EQ96PG1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A4EQ96PG1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A4EQ96PG1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A4EQ96PG1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A4EQ96PG1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A4EQ96PG1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A4EQ96PG1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A4EQ96PG1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A4EQ96PG1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A4EQ96PG1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A4EQ96PG1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A4EQ96PG1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A4EQ96PG1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A4EQ96PG1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A4EQ96PG1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A4EQ96PG1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A4EQ96PG1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A4EQ96PG1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A4EQ96PG1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A4EQ96PG1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MS4A4EQ96PG1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MS4A4EQ96PG1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MS4A4EQ96PG1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A4EQ96PG1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A4EQ96PG1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A4EQ96PG1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A4EQ96PG1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A4EQ96PG1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A4EQ96PG1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A4EQ96PG1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A4EQ96PG1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A4EQ96PG1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A4EQ96PG1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A4EQ96PG1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A4EQ96PG1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A4EQ96PG1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A4EQ96PG1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A4EQ96PG1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A4EQ96PG1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A4EQ96PG1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A4EQ96PG1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A4EQ96PG1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A4EQ96PG1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A4EQ96PG1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A4EQ96PG1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A4EQ96PG1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A4EQ96PG1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A4EQ96PG1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A4EQ96PG1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A4EQ96PG1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MS4A4EQ96PG1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MS4A4EQ96PG1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MS4A4EQ96PG1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MS4A4EQ96PG1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MS4A4EQ96PG1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A4EQ96PG1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A4EQ96PG1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A4EQ96PG1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A4EQ96PG1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A4EQ96PG1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A4EQ96PG1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A4EQ96PG1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A4EQ96PG1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A4EQ96PG1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A4EQ96PG1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A4EQ96PG1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A4EQ96PG1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A4EQ96PG1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A4EQ96PG1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A4EQ96PG1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A4EQ96PG1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A4EQ96PG1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A4EQ96PG1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MS4A4EQ96PG1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MS4A4EQ96PG1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MS4A4EQ96PG1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MS4A4EQ96PG1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MS4A4EQ96PG1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MS4A4EQ96PG1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MS4A4EQ96PG1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MS4A4EQ96PG1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MS4A4EQ96PG1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MS4A4EQ96PG1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MS4A4EQ96PG1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MS4A4EQ96PG1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MS4A4EQ96PG1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MS4A4EQ96PG1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MS4A4EQ96PG1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MS4A4EQ96PG1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MS4A4EQ96PG1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MS4A4EQ96PG1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MS4A4EQ96PG1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms