Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
FGD4Q96M96 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FGD4Q96M96 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FGD4Q96M96 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FGD4Q96M96 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FGD4Q96M96 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FGD4Q96M96 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FGD4Q96M96 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FGD4Q96M96 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FGD4Q96M96 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FGD4Q96M96 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FGD4Q96M96 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FGD4Q96M96 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FGD4Q96M96 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FGD4Q96M96 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FGD4Q96M96 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FGD4Q96M96 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
FGD4Q96M96 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
FGD4Q96M96 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FGD4Q96M96 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FGD4Q96M96 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FGD4Q96M96 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FGD4Q96M96 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FGD4Q96M96 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FGD4Q96M96 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FGD4Q96M96 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FGD4Q96M96 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FGD4Q96M96 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FGD4Q96M96 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FGD4Q96M96 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FGD4Q96M96 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FGD4Q96M96 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FGD4Q96M96 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FGD4Q96M96 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FGD4Q96M96 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FGD4Q96M96 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FGD4Q96M96 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FGD4Q96M96 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FGD4Q96M96 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FGD4Q96M96 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FGD4Q96M96 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
FGD4Q96M96 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FGD4Q96M96 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FGD4Q96M96 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FGD4Q96M96 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FGD4Q96M96 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FGD4Q96M96 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FGD4Q96M96 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FGD4Q96M96 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FGD4Q96M96 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FGD4Q96M96 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FGD4Q96M96 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FGD4Q96M96 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FGD4Q96M96 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FGD4Q96M96 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
FGD4Q96M96 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
FGD4Q96M96 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FGD4Q96M96 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FGD4Q96M96 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FGD4Q96M96 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FGD4Q96M96 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
FGD4Q96M96 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FGD4Q96M96 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FGD4Q96M96 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FGD4Q96M96 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FGD4Q96M96 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FGD4Q96M96 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
FGD4Q96M96 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FGD4Q96M96 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FGD4Q96M96 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FGD4Q96M96 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FGD4Q96M96 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
FGD4Q96M96 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FGD4Q96M96 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FGD4Q96M96 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
FGD4Q96M96 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FGD4Q96M96 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FGD4Q96M96 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FGD4Q96M96 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FGD4Q96M96 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FGD4Q96M96 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FGD4Q96M96 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FGD4Q96M96 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
FGD4Q96M96 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FGD4Q96M96 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FGD4Q96M96 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FGD4Q96M96 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FGD4Q96M96 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FGD4Q96M96 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FGD4Q96M96 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
FGD4Q96M96 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FGD4Q96M96 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FGD4Q96M96 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FGD4Q96M96 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FGD4Q96M96 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FGD4Q96M96 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FGD4Q96M96 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FGD4Q96M96 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
FGD4Q96M96 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FGD4Q96M96 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms