Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB9

PGLYRP3, Peptidoglycan recognition protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP3Q96LB9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PGLYRP3Q96LB9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGLYRP3Q96LB9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGLYRP3Q96LB9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGLYRP3Q96LB9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGLYRP3Q96LB9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGLYRP3Q96LB9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGLYRP3Q96LB9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGLYRP3Q96LB9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGLYRP3Q96LB9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGLYRP3Q96LB9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGLYRP3Q96LB9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGLYRP3Q96LB9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGLYRP3Q96LB9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGLYRP3Q96LB9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGLYRP3Q96LB9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGLYRP3Q96LB9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGLYRP3Q96LB9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGLYRP3Q96LB9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGLYRP3Q96LB9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGLYRP3Q96LB9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PGLYRP3Q96LB9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGLYRP3Q96LB9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGLYRP3Q96LB9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGLYRP3Q96LB9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGLYRP3Q96LB9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGLYRP3Q96LB9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGLYRP3Q96LB9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGLYRP3Q96LB9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGLYRP3Q96LB9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGLYRP3Q96LB9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGLYRP3Q96LB9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGLYRP3Q96LB9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGLYRP3Q96LB9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGLYRP3Q96LB9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGLYRP3Q96LB9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGLYRP3Q96LB9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
PGLYRP3Q96LB9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGLYRP3Q96LB9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGLYRP3Q96LB9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PGLYRP3Q96LB9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PGLYRP3Q96LB9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGLYRP3Q96LB9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGLYRP3Q96LB9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGLYRP3Q96LB9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGLYRP3Q96LB9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGLYRP3Q96LB9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGLYRP3Q96LB9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGLYRP3Q96LB9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGLYRP3Q96LB9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGLYRP3Q96LB9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGLYRP3Q96LB9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGLYRP3Q96LB9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGLYRP3Q96LB9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PGLYRP3Q96LB9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGLYRP3Q96LB9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGLYRP3Q96LB9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGLYRP3Q96LB9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGLYRP3Q96LB9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGLYRP3Q96LB9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGLYRP3Q96LB9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PGLYRP3Q96LB9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGLYRP3Q96LB9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGLYRP3Q96LB9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGLYRP3Q96LB9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGLYRP3Q96LB9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGLYRP3Q96LB9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PGLYRP3Q96LB9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGLYRP3Q96LB9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PGLYRP3Q96LB9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PGLYRP3Q96LB9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PGLYRP3Q96LB9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PGLYRP3Q96LB9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PGLYRP3Q96LB9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PGLYRP3Q96LB9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PGLYRP3Q96LB9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGLYRP3Q96LB9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGLYRP3Q96LB9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGLYRP3Q96LB9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGLYRP3Q96LB9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PGLYRP3Q96LB9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PGLYRP3Q96LB9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PGLYRP3Q96LB9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PGLYRP3Q96LB9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PGLYRP3Q96LB9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PGLYRP3Q96LB9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGLYRP3Q96LB9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGLYRP3Q96LB9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGLYRP3Q96LB9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PGLYRP3Q96LB9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGLYRP3Q96LB9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGLYRP3Q96LB9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGLYRP3Q96LB9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGLYRP3Q96LB9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGLYRP3Q96LB9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGLYRP3Q96LB9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGLYRP3Q96LB9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGLYRP3Q96LB9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGLYRP3Q96LB9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGLYRP3Q96LB9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms