Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC34Q96HJ3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC34Q96HJ3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC34Q96HJ3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC34Q96HJ3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC34Q96HJ3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC34Q96HJ3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC34Q96HJ3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC34Q96HJ3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC34Q96HJ3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC34Q96HJ3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC34Q96HJ3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC34Q96HJ3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC34Q96HJ3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC34Q96HJ3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC34Q96HJ3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC34Q96HJ3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC34Q96HJ3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC34Q96HJ3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC34Q96HJ3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC34Q96HJ3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC34Q96HJ3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC34Q96HJ3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC34Q96HJ3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC34Q96HJ3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC34Q96HJ3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC34Q96HJ3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC34Q96HJ3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CCDC34Q96HJ3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC34Q96HJ3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC34Q96HJ3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC34Q96HJ3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC34Q96HJ3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC34Q96HJ3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC34Q96HJ3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC34Q96HJ3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC34Q96HJ3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC34Q96HJ3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC34Q96HJ3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC34Q96HJ3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC34Q96HJ3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC34Q96HJ3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC34Q96HJ3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC34Q96HJ3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC34Q96HJ3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC34Q96HJ3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC34Q96HJ3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC34Q96HJ3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC34Q96HJ3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC34Q96HJ3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC34Q96HJ3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC34Q96HJ3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC34Q96HJ3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC34Q96HJ3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC34Q96HJ3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC34Q96HJ3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC34Q96HJ3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC34Q96HJ3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC34Q96HJ3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC34Q96HJ3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC34Q96HJ3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC34Q96HJ3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC34Q96HJ3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC34Q96HJ3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC34Q96HJ3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC34Q96HJ3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC34Q96HJ3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC34Q96HJ3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC34Q96HJ3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC34Q96HJ3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC34Q96HJ3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC34Q96HJ3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC34Q96HJ3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC34Q96HJ3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC34Q96HJ3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC34Q96HJ3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC34Q96HJ3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC34Q96HJ3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC34Q96HJ3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC34Q96HJ3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC34Q96HJ3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC34Q96HJ3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC34Q96HJ3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC34Q96HJ3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC34Q96HJ3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC34Q96HJ3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC34Q96HJ3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC34Q96HJ3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC34Q96HJ3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC34Q96HJ3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC34Q96HJ3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC34Q96HJ3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC34Q96HJ3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC34Q96HJ3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC34Q96HJ3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC34Q96HJ3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC34Q96HJ3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC34Q96HJ3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC34Q96HJ3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC34Q96HJ3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms