Protein–RNA interactions for Protein: Q96EA4

SPDL1, Protein Spindly, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDL1Q96EA4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPDL1Q96EA4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPDL1Q96EA4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPDL1Q96EA4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPDL1Q96EA4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPDL1Q96EA4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SPDL1Q96EA4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPDL1Q96EA4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPDL1Q96EA4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPDL1Q96EA4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPDL1Q96EA4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPDL1Q96EA4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPDL1Q96EA4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPDL1Q96EA4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPDL1Q96EA4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPDL1Q96EA4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPDL1Q96EA4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPDL1Q96EA4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPDL1Q96EA4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPDL1Q96EA4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPDL1Q96EA4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPDL1Q96EA4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPDL1Q96EA4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPDL1Q96EA4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPDL1Q96EA4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPDL1Q96EA4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPDL1Q96EA4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPDL1Q96EA4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPDL1Q96EA4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPDL1Q96EA4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPDL1Q96EA4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPDL1Q96EA4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPDL1Q96EA4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPDL1Q96EA4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPDL1Q96EA4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SPDL1Q96EA4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPDL1Q96EA4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SPDL1Q96EA4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPDL1Q96EA4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPDL1Q96EA4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPDL1Q96EA4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPDL1Q96EA4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPDL1Q96EA4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPDL1Q96EA4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPDL1Q96EA4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPDL1Q96EA4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPDL1Q96EA4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPDL1Q96EA4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPDL1Q96EA4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPDL1Q96EA4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPDL1Q96EA4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPDL1Q96EA4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPDL1Q96EA4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPDL1Q96EA4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPDL1Q96EA4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPDL1Q96EA4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPDL1Q96EA4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPDL1Q96EA4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPDL1Q96EA4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPDL1Q96EA4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPDL1Q96EA4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPDL1Q96EA4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPDL1Q96EA4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPDL1Q96EA4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPDL1Q96EA4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPDL1Q96EA4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPDL1Q96EA4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPDL1Q96EA4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPDL1Q96EA4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPDL1Q96EA4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPDL1Q96EA4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPDL1Q96EA4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPDL1Q96EA4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPDL1Q96EA4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPDL1Q96EA4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPDL1Q96EA4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPDL1Q96EA4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPDL1Q96EA4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPDL1Q96EA4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SPDL1Q96EA4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPDL1Q96EA4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SPDL1Q96EA4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPDL1Q96EA4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPDL1Q96EA4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPDL1Q96EA4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPDL1Q96EA4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPDL1Q96EA4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SPDL1Q96EA4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPDL1Q96EA4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPDL1Q96EA4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPDL1Q96EA4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPDL1Q96EA4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPDL1Q96EA4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPDL1Q96EA4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPDL1Q96EA4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SPDL1Q96EA4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPDL1Q96EA4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPDL1Q96EA4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPDL1Q96EA4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPDL1Q96EA4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms