Protein–RNA interactions for Protein: Q96DI7

SNRNP40, U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP40Q96DI7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRNP40Q96DI7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRNP40Q96DI7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRNP40Q96DI7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRNP40Q96DI7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRNP40Q96DI7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRNP40Q96DI7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRNP40Q96DI7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRNP40Q96DI7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRNP40Q96DI7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRNP40Q96DI7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRNP40Q96DI7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRNP40Q96DI7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRNP40Q96DI7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRNP40Q96DI7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRNP40Q96DI7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRNP40Q96DI7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRNP40Q96DI7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRNP40Q96DI7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRNP40Q96DI7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRNP40Q96DI7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRNP40Q96DI7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRNP40Q96DI7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRNP40Q96DI7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRNP40Q96DI7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRNP40Q96DI7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRNP40Q96DI7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRNP40Q96DI7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRNP40Q96DI7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRNP40Q96DI7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRNP40Q96DI7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRNP40Q96DI7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRNP40Q96DI7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRNP40Q96DI7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRNP40Q96DI7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRNP40Q96DI7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRNP40Q96DI7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRNP40Q96DI7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRNP40Q96DI7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRNP40Q96DI7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRNP40Q96DI7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRNP40Q96DI7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRNP40Q96DI7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRNP40Q96DI7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRNP40Q96DI7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRNP40Q96DI7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRNP40Q96DI7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRNP40Q96DI7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRNP40Q96DI7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRNP40Q96DI7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRNP40Q96DI7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRNP40Q96DI7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRNP40Q96DI7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRNP40Q96DI7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRNP40Q96DI7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRNP40Q96DI7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRNP40Q96DI7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRNP40Q96DI7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRNP40Q96DI7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRNP40Q96DI7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRNP40Q96DI7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRNP40Q96DI7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRNP40Q96DI7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRNP40Q96DI7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRNP40Q96DI7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRNP40Q96DI7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRNP40Q96DI7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRNP40Q96DI7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRNP40Q96DI7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRNP40Q96DI7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRNP40Q96DI7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRNP40Q96DI7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRNP40Q96DI7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRNP40Q96DI7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRNP40Q96DI7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRNP40Q96DI7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRNP40Q96DI7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRNP40Q96DI7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRNP40Q96DI7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRNP40Q96DI7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRNP40Q96DI7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRNP40Q96DI7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRNP40Q96DI7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRNP40Q96DI7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRNP40Q96DI7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRNP40Q96DI7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRNP40Q96DI7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRNP40Q96DI7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRNP40Q96DI7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRNP40Q96DI7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRNP40Q96DI7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRNP40Q96DI7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRNP40Q96DI7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRNP40Q96DI7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRNP40Q96DI7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRNP40Q96DI7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRNP40Q96DI7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRNP40Q96DI7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRNP40Q96DI7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRNP40Q96DI7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms