Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP7

TLCD1, Calfacilitin, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLCD1Q96CP7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TLCD1Q96CP7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TLCD1Q96CP7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TLCD1Q96CP7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TLCD1Q96CP7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TLCD1Q96CP7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TLCD1Q96CP7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TLCD1Q96CP7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TLCD1Q96CP7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TLCD1Q96CP7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TLCD1Q96CP7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TLCD1Q96CP7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TLCD1Q96CP7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TLCD1Q96CP7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TLCD1Q96CP7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TLCD1Q96CP7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TLCD1Q96CP7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TLCD1Q96CP7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TLCD1Q96CP7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TLCD1Q96CP7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TLCD1Q96CP7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TLCD1Q96CP7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TLCD1Q96CP7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TLCD1Q96CP7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TLCD1Q96CP7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TLCD1Q96CP7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TLCD1Q96CP7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TLCD1Q96CP7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TLCD1Q96CP7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TLCD1Q96CP7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TLCD1Q96CP7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TLCD1Q96CP7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TLCD1Q96CP7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TLCD1Q96CP7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TLCD1Q96CP7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TLCD1Q96CP7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TLCD1Q96CP7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TLCD1Q96CP7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TLCD1Q96CP7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TLCD1Q96CP7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TLCD1Q96CP7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TLCD1Q96CP7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TLCD1Q96CP7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TLCD1Q96CP7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TLCD1Q96CP7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TLCD1Q96CP7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TLCD1Q96CP7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TLCD1Q96CP7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TLCD1Q96CP7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TLCD1Q96CP7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TLCD1Q96CP7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TLCD1Q96CP7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLCD1Q96CP7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLCD1Q96CP7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLCD1Q96CP7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLCD1Q96CP7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLCD1Q96CP7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLCD1Q96CP7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TLCD1Q96CP7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TLCD1Q96CP7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TLCD1Q96CP7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TLCD1Q96CP7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TLCD1Q96CP7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TLCD1Q96CP7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TLCD1Q96CP7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TLCD1Q96CP7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TLCD1Q96CP7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TLCD1Q96CP7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TLCD1Q96CP7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TLCD1Q96CP7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TLCD1Q96CP7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TLCD1Q96CP7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TLCD1Q96CP7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TLCD1Q96CP7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TLCD1Q96CP7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TLCD1Q96CP7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TLCD1Q96CP7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TLCD1Q96CP7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TLCD1Q96CP7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TLCD1Q96CP7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TLCD1Q96CP7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TLCD1Q96CP7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TLCD1Q96CP7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLCD1Q96CP7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TLCD1Q96CP7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TLCD1Q96CP7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TLCD1Q96CP7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TLCD1Q96CP7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TLCD1Q96CP7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TLCD1Q96CP7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TLCD1Q96CP7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TLCD1Q96CP7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TLCD1Q96CP7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TLCD1Q96CP7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TLCD1Q96CP7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TLCD1Q96CP7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TLCD1Q96CP7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TLCD1Q96CP7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TLCD1Q96CP7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TLCD1Q96CP7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms