Protein–RNA interactions for Protein: Q92621

NUP205, Nuclear pore complex protein Nup205, humanhuman

Predictions only

Length 2,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP205Q92621 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUP205Q92621 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUP205Q92621 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUP205Q92621 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUP205Q92621 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUP205Q92621 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUP205Q92621 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUP205Q92621 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUP205Q92621 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUP205Q92621 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUP205Q92621 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUP205Q92621 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUP205Q92621 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUP205Q92621 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUP205Q92621 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUP205Q92621 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUP205Q92621 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUP205Q92621 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUP205Q92621 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUP205Q92621 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NUP205Q92621 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NUP205Q92621 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP205Q92621 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP205Q92621 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP205Q92621 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP205Q92621 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP205Q92621 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP205Q92621 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP205Q92621 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP205Q92621 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP205Q92621 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP205Q92621 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP205Q92621 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP205Q92621 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP205Q92621 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP205Q92621 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP205Q92621 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP205Q92621 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP205Q92621 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP205Q92621 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP205Q92621 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP205Q92621 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP205Q92621 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP205Q92621 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP205Q92621 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP205Q92621 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP205Q92621 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP205Q92621 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP205Q92621 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP205Q92621 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP205Q92621 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP205Q92621 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP205Q92621 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP205Q92621 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP205Q92621 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP205Q92621 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP205Q92621 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP205Q92621 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP205Q92621 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP205Q92621 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP205Q92621 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP205Q92621 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP205Q92621 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP205Q92621 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP205Q92621 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
NUP205Q92621 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
NUP205Q92621 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP205Q92621 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP205Q92621 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP205Q92621 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUP205Q92621 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUP205Q92621 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUP205Q92621 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUP205Q92621 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP205Q92621 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP205Q92621 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP205Q92621 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP205Q92621 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP205Q92621 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP205Q92621 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP205Q92621 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP205Q92621 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP205Q92621 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP205Q92621 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP205Q92621 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP205Q92621 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP205Q92621 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP205Q92621 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP205Q92621 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP205Q92621 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NUP205Q92621 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
NUP205Q92621 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NUP205Q92621 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUP205Q92621 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUP205Q92621 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NUP205Q92621 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NUP205Q92621 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUP205Q92621 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUP205Q92621 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUP205Q92621 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154 ms