Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM3CQ92520 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM3CQ92520 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM3CQ92520 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM3CQ92520 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM3CQ92520 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM3CQ92520 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM3CQ92520 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM3CQ92520 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM3CQ92520 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM3CQ92520 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM3CQ92520 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM3CQ92520 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM3CQ92520 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM3CQ92520 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM3CQ92520 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM3CQ92520 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM3CQ92520 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM3CQ92520 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM3CQ92520 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM3CQ92520 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM3CQ92520 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM3CQ92520 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM3CQ92520 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM3CQ92520 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM3CQ92520 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM3CQ92520 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM3CQ92520 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM3CQ92520 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM3CQ92520 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM3CQ92520 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM3CQ92520 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM3CQ92520 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM3CQ92520 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM3CQ92520 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM3CQ92520 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM3CQ92520 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM3CQ92520 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM3CQ92520 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM3CQ92520 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM3CQ92520 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM3CQ92520 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
FAM3CQ92520 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM3CQ92520 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM3CQ92520 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM3CQ92520 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM3CQ92520 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM3CQ92520 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM3CQ92520 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM3CQ92520 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM3CQ92520 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM3CQ92520 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM3CQ92520 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM3CQ92520 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM3CQ92520 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM3CQ92520 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM3CQ92520 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM3CQ92520 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM3CQ92520 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM3CQ92520 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM3CQ92520 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM3CQ92520 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FAM3CQ92520 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
FAM3CQ92520 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM3CQ92520 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM3CQ92520 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM3CQ92520 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM3CQ92520 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM3CQ92520 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM3CQ92520 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM3CQ92520 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM3CQ92520 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM3CQ92520 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM3CQ92520 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM3CQ92520 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM3CQ92520 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM3CQ92520 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM3CQ92520 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM3CQ92520 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM3CQ92520 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM3CQ92520 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM3CQ92520 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM3CQ92520 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM3CQ92520 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM3CQ92520 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM3CQ92520 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM3CQ92520 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM3CQ92520 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM3CQ92520 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM3CQ92520 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM3CQ92520 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM3CQ92520 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM3CQ92520 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM3CQ92520 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM3CQ92520 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM3CQ92520 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM3CQ92520 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM3CQ92520 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM3CQ92520 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM3CQ92520 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms