Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ04

LRTOMT, Transmembrane O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRTOMTQ8WZ04 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRTOMTQ8WZ04 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRTOMTQ8WZ04 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRTOMTQ8WZ04 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRTOMTQ8WZ04 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRTOMTQ8WZ04 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRTOMTQ8WZ04 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRTOMTQ8WZ04 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRTOMTQ8WZ04 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRTOMTQ8WZ04 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LRTOMTQ8WZ04 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRTOMTQ8WZ04 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRTOMTQ8WZ04 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRTOMTQ8WZ04 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRTOMTQ8WZ04 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRTOMTQ8WZ04 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRTOMTQ8WZ04 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRTOMTQ8WZ04 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRTOMTQ8WZ04 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRTOMTQ8WZ04 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRTOMTQ8WZ04 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRTOMTQ8WZ04 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRTOMTQ8WZ04 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRTOMTQ8WZ04 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRTOMTQ8WZ04 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRTOMTQ8WZ04 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRTOMTQ8WZ04 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRTOMTQ8WZ04 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRTOMTQ8WZ04 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRTOMTQ8WZ04 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRTOMTQ8WZ04 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LRTOMTQ8WZ04 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRTOMTQ8WZ04 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRTOMTQ8WZ04 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRTOMTQ8WZ04 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRTOMTQ8WZ04 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRTOMTQ8WZ04 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRTOMTQ8WZ04 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRTOMTQ8WZ04 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRTOMTQ8WZ04 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRTOMTQ8WZ04 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRTOMTQ8WZ04 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRTOMTQ8WZ04 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRTOMTQ8WZ04 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRTOMTQ8WZ04 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRTOMTQ8WZ04 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRTOMTQ8WZ04 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LRTOMTQ8WZ04 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRTOMTQ8WZ04 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRTOMTQ8WZ04 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRTOMTQ8WZ04 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRTOMTQ8WZ04 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRTOMTQ8WZ04 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRTOMTQ8WZ04 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRTOMTQ8WZ04 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRTOMTQ8WZ04 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRTOMTQ8WZ04 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRTOMTQ8WZ04 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRTOMTQ8WZ04 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRTOMTQ8WZ04 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LRTOMTQ8WZ04 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRTOMTQ8WZ04 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRTOMTQ8WZ04 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRTOMTQ8WZ04 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRTOMTQ8WZ04 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRTOMTQ8WZ04 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRTOMTQ8WZ04 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRTOMTQ8WZ04 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRTOMTQ8WZ04 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRTOMTQ8WZ04 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRTOMTQ8WZ04 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRTOMTQ8WZ04 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRTOMTQ8WZ04 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRTOMTQ8WZ04 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRTOMTQ8WZ04 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRTOMTQ8WZ04 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRTOMTQ8WZ04 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRTOMTQ8WZ04 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRTOMTQ8WZ04 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRTOMTQ8WZ04 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRTOMTQ8WZ04 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRTOMTQ8WZ04 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRTOMTQ8WZ04 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRTOMTQ8WZ04 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRTOMTQ8WZ04 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRTOMTQ8WZ04 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRTOMTQ8WZ04 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRTOMTQ8WZ04 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRTOMTQ8WZ04 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRTOMTQ8WZ04 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRTOMTQ8WZ04 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRTOMTQ8WZ04 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRTOMTQ8WZ04 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRTOMTQ8WZ04 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRTOMTQ8WZ04 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRTOMTQ8WZ04 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRTOMTQ8WZ04 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRTOMTQ8WZ04 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRTOMTQ8WZ04 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRTOMTQ8WZ04 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms