Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX92

NELFB, Negative elongation factor B, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFBQ8WX92 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NELFBQ8WX92 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NELFBQ8WX92 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NELFBQ8WX92 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NELFBQ8WX92 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NELFBQ8WX92 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NELFBQ8WX92 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NELFBQ8WX92 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NELFBQ8WX92 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NELFBQ8WX92 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NELFBQ8WX92 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NELFBQ8WX92 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NELFBQ8WX92 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NELFBQ8WX92 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NELFBQ8WX92 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NELFBQ8WX92 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NELFBQ8WX92 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NELFBQ8WX92 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NELFBQ8WX92 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NELFBQ8WX92 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NELFBQ8WX92 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NELFBQ8WX92 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NELFBQ8WX92 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NELFBQ8WX92 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NELFBQ8WX92 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NELFBQ8WX92 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NELFBQ8WX92 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NELFBQ8WX92 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NELFBQ8WX92 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NELFBQ8WX92 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NELFBQ8WX92 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NELFBQ8WX92 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NELFBQ8WX92 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NELFBQ8WX92 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
NELFBQ8WX92 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NELFBQ8WX92 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NELFBQ8WX92 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NELFBQ8WX92 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NELFBQ8WX92 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NELFBQ8WX92 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NELFBQ8WX92 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NELFBQ8WX92 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NELFBQ8WX92 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NELFBQ8WX92 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NELFBQ8WX92 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NELFBQ8WX92 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NELFBQ8WX92 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NELFBQ8WX92 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NELFBQ8WX92 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NELFBQ8WX92 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NELFBQ8WX92 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NELFBQ8WX92 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NELFBQ8WX92 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NELFBQ8WX92 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NELFBQ8WX92 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NELFBQ8WX92 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NELFBQ8WX92 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NELFBQ8WX92 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NELFBQ8WX92 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NELFBQ8WX92 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NELFBQ8WX92 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NELFBQ8WX92 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NELFBQ8WX92 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NELFBQ8WX92 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NELFBQ8WX92 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NELFBQ8WX92 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NELFBQ8WX92 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NELFBQ8WX92 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NELFBQ8WX92 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NELFBQ8WX92 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NELFBQ8WX92 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NELFBQ8WX92 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NELFBQ8WX92 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NELFBQ8WX92 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NELFBQ8WX92 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NELFBQ8WX92 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NELFBQ8WX92 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NELFBQ8WX92 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NELFBQ8WX92 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NELFBQ8WX92 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NELFBQ8WX92 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NELFBQ8WX92 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NELFBQ8WX92 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NELFBQ8WX92 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NELFBQ8WX92 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NELFBQ8WX92 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NELFBQ8WX92 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NELFBQ8WX92 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NELFBQ8WX92 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NELFBQ8WX92 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NELFBQ8WX92 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NELFBQ8WX92 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NELFBQ8WX92 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NELFBQ8WX92 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NELFBQ8WX92 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NELFBQ8WX92 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NELFBQ8WX92 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NELFBQ8WX92 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NELFBQ8WX92 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NELFBQ8WX92 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms