Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC107Q8WV48 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC107Q8WV48 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC107Q8WV48 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC107Q8WV48 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC107Q8WV48 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC107Q8WV48 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC107Q8WV48 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC107Q8WV48 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC107Q8WV48 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC107Q8WV48 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC107Q8WV48 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC107Q8WV48 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC107Q8WV48 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC107Q8WV48 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC107Q8WV48 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC107Q8WV48 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC107Q8WV48 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC107Q8WV48 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC107Q8WV48 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC107Q8WV48 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC107Q8WV48 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC107Q8WV48 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC107Q8WV48 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC107Q8WV48 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC107Q8WV48 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC107Q8WV48 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC107Q8WV48 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC107Q8WV48 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC107Q8WV48 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC107Q8WV48 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC107Q8WV48 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC107Q8WV48 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC107Q8WV48 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC107Q8WV48 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC107Q8WV48 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC107Q8WV48 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC107Q8WV48 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC107Q8WV48 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC107Q8WV48 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC107Q8WV48 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC107Q8WV48 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC107Q8WV48 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC107Q8WV48 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC107Q8WV48 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC107Q8WV48 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC107Q8WV48 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC107Q8WV48 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC107Q8WV48 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC107Q8WV48 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC107Q8WV48 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC107Q8WV48 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC107Q8WV48 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC107Q8WV48 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC107Q8WV48 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC107Q8WV48 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC107Q8WV48 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC107Q8WV48 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC107Q8WV48 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC107Q8WV48 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC107Q8WV48 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC107Q8WV48 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC107Q8WV48 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC107Q8WV48 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC107Q8WV48 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC107Q8WV48 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC107Q8WV48 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC107Q8WV48 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC107Q8WV48 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC107Q8WV48 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC107Q8WV48 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC107Q8WV48 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC107Q8WV48 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC107Q8WV48 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC107Q8WV48 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC107Q8WV48 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC107Q8WV48 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC107Q8WV48 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC107Q8WV48 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC107Q8WV48 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC107Q8WV48 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC107Q8WV48 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC107Q8WV48 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC107Q8WV48 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC107Q8WV48 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC107Q8WV48 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC107Q8WV48 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC107Q8WV48 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC107Q8WV48 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC107Q8WV48 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC107Q8WV48 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC107Q8WV48 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC107Q8WV48 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC107Q8WV48 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC107Q8WV48 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC107Q8WV48 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC107Q8WV48 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC107Q8WV48 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC107Q8WV48 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC107Q8WV48 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms