Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV41

SNX33, Sorting nexin-33, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX33Q8WV41 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX33Q8WV41 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX33Q8WV41 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX33Q8WV41 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX33Q8WV41 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX33Q8WV41 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX33Q8WV41 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX33Q8WV41 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX33Q8WV41 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX33Q8WV41 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX33Q8WV41 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX33Q8WV41 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX33Q8WV41 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX33Q8WV41 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX33Q8WV41 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SNX33Q8WV41 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SNX33Q8WV41 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX33Q8WV41 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX33Q8WV41 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX33Q8WV41 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX33Q8WV41 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX33Q8WV41 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX33Q8WV41 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX33Q8WV41 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX33Q8WV41 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX33Q8WV41 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX33Q8WV41 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX33Q8WV41 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX33Q8WV41 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX33Q8WV41 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX33Q8WV41 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX33Q8WV41 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX33Q8WV41 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX33Q8WV41 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX33Q8WV41 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX33Q8WV41 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX33Q8WV41 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX33Q8WV41 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX33Q8WV41 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX33Q8WV41 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX33Q8WV41 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX33Q8WV41 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX33Q8WV41 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX33Q8WV41 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX33Q8WV41 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX33Q8WV41 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX33Q8WV41 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX33Q8WV41 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX33Q8WV41 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX33Q8WV41 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX33Q8WV41 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX33Q8WV41 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX33Q8WV41 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX33Q8WV41 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX33Q8WV41 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX33Q8WV41 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX33Q8WV41 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX33Q8WV41 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX33Q8WV41 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX33Q8WV41 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX33Q8WV41 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX33Q8WV41 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX33Q8WV41 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX33Q8WV41 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX33Q8WV41 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX33Q8WV41 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX33Q8WV41 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX33Q8WV41 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX33Q8WV41 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX33Q8WV41 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX33Q8WV41 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX33Q8WV41 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX33Q8WV41 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX33Q8WV41 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX33Q8WV41 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX33Q8WV41 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX33Q8WV41 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX33Q8WV41 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX33Q8WV41 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX33Q8WV41 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX33Q8WV41 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX33Q8WV41 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX33Q8WV41 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX33Q8WV41 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX33Q8WV41 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX33Q8WV41 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX33Q8WV41 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX33Q8WV41 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX33Q8WV41 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX33Q8WV41 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX33Q8WV41 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX33Q8WV41 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX33Q8WV41 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX33Q8WV41 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX33Q8WV41 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX33Q8WV41 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX33Q8WV41 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX33Q8WV41 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX33Q8WV41 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX33Q8WV41 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms