Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFT2D1Q8WV19 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFT2D1Q8WV19 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFT2D1Q8WV19 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFT2D1Q8WV19 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFT2D1Q8WV19 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFT2D1Q8WV19 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFT2D1Q8WV19 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFT2D1Q8WV19 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFT2D1Q8WV19 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFT2D1Q8WV19 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFT2D1Q8WV19 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFT2D1Q8WV19 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFT2D1Q8WV19 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFT2D1Q8WV19 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFT2D1Q8WV19 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFT2D1Q8WV19 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFT2D1Q8WV19 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFT2D1Q8WV19 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFT2D1Q8WV19 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFT2D1Q8WV19 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SFT2D1Q8WV19 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFT2D1Q8WV19 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFT2D1Q8WV19 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFT2D1Q8WV19 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFT2D1Q8WV19 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFT2D1Q8WV19 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFT2D1Q8WV19 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFT2D1Q8WV19 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFT2D1Q8WV19 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SFT2D1Q8WV19 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFT2D1Q8WV19 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFT2D1Q8WV19 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFT2D1Q8WV19 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFT2D1Q8WV19 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFT2D1Q8WV19 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFT2D1Q8WV19 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFT2D1Q8WV19 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFT2D1Q8WV19 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFT2D1Q8WV19 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFT2D1Q8WV19 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFT2D1Q8WV19 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFT2D1Q8WV19 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFT2D1Q8WV19 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFT2D1Q8WV19 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFT2D1Q8WV19 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFT2D1Q8WV19 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFT2D1Q8WV19 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFT2D1Q8WV19 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SFT2D1Q8WV19 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFT2D1Q8WV19 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFT2D1Q8WV19 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFT2D1Q8WV19 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFT2D1Q8WV19 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFT2D1Q8WV19 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFT2D1Q8WV19 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFT2D1Q8WV19 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFT2D1Q8WV19 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFT2D1Q8WV19 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SFT2D1Q8WV19 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFT2D1Q8WV19 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFT2D1Q8WV19 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFT2D1Q8WV19 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFT2D1Q8WV19 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFT2D1Q8WV19 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFT2D1Q8WV19 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SFT2D1Q8WV19 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SFT2D1Q8WV19 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SFT2D1Q8WV19 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SFT2D1Q8WV19 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFT2D1Q8WV19 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFT2D1Q8WV19 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFT2D1Q8WV19 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFT2D1Q8WV19 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFT2D1Q8WV19 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFT2D1Q8WV19 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFT2D1Q8WV19 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFT2D1Q8WV19 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFT2D1Q8WV19 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFT2D1Q8WV19 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFT2D1Q8WV19 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFT2D1Q8WV19 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFT2D1Q8WV19 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFT2D1Q8WV19 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFT2D1Q8WV19 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFT2D1Q8WV19 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFT2D1Q8WV19 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFT2D1Q8WV19 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFT2D1Q8WV19 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFT2D1Q8WV19 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFT2D1Q8WV19 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFT2D1Q8WV19 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFT2D1Q8WV19 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SFT2D1Q8WV19 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SFT2D1Q8WV19 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SFT2D1Q8WV19 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SFT2D1Q8WV19 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SFT2D1Q8WV19 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SFT2D1Q8WV19 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFT2D1Q8WV19 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms