Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C15orf40Q8WUR7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C15orf40Q8WUR7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
C15orf40Q8WUR7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C15orf40Q8WUR7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C15orf40Q8WUR7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C15orf40Q8WUR7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
C15orf40Q8WUR7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C15orf40Q8WUR7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C15orf40Q8WUR7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C15orf40Q8WUR7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C15orf40Q8WUR7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C15orf40Q8WUR7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C15orf40Q8WUR7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C15orf40Q8WUR7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C15orf40Q8WUR7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C15orf40Q8WUR7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C15orf40Q8WUR7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C15orf40Q8WUR7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C15orf40Q8WUR7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C15orf40Q8WUR7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C15orf40Q8WUR7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
C15orf40Q8WUR7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C15orf40Q8WUR7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C15orf40Q8WUR7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C15orf40Q8WUR7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C15orf40Q8WUR7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C15orf40Q8WUR7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C15orf40Q8WUR7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C15orf40Q8WUR7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C15orf40Q8WUR7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C15orf40Q8WUR7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C15orf40Q8WUR7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C15orf40Q8WUR7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C15orf40Q8WUR7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C15orf40Q8WUR7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
C15orf40Q8WUR7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C15orf40Q8WUR7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C15orf40Q8WUR7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C15orf40Q8WUR7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C15orf40Q8WUR7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C15orf40Q8WUR7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C15orf40Q8WUR7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C15orf40Q8WUR7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C15orf40Q8WUR7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
C15orf40Q8WUR7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C15orf40Q8WUR7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C15orf40Q8WUR7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C15orf40Q8WUR7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C15orf40Q8WUR7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C15orf40Q8WUR7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C15orf40Q8WUR7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C15orf40Q8WUR7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C15orf40Q8WUR7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C15orf40Q8WUR7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C15orf40Q8WUR7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
C15orf40Q8WUR7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C15orf40Q8WUR7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C15orf40Q8WUR7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
C15orf40Q8WUR7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C15orf40Q8WUR7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C15orf40Q8WUR7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C15orf40Q8WUR7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C15orf40Q8WUR7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C15orf40Q8WUR7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C15orf40Q8WUR7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C15orf40Q8WUR7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C15orf40Q8WUR7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C15orf40Q8WUR7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C15orf40Q8WUR7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C15orf40Q8WUR7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C15orf40Q8WUR7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C15orf40Q8WUR7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C15orf40Q8WUR7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C15orf40Q8WUR7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C15orf40Q8WUR7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C15orf40Q8WUR7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C15orf40Q8WUR7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C15orf40Q8WUR7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C15orf40Q8WUR7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C15orf40Q8WUR7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C15orf40Q8WUR7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C15orf40Q8WUR7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C15orf40Q8WUR7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C15orf40Q8WUR7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C15orf40Q8WUR7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C15orf40Q8WUR7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C15orf40Q8WUR7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C15orf40Q8WUR7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C15orf40Q8WUR7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C15orf40Q8WUR7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C15orf40Q8WUR7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C15orf40Q8WUR7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C15orf40Q8WUR7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C15orf40Q8WUR7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C15orf40Q8WUR7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C15orf40Q8WUR7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C15orf40Q8WUR7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C15orf40Q8WUR7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C15orf40Q8WUR7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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