Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD19

NEK9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK9Q8TD19 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEK9Q8TD19 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEK9Q8TD19 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEK9Q8TD19 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEK9Q8TD19 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEK9Q8TD19 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEK9Q8TD19 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEK9Q8TD19 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEK9Q8TD19 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NEK9Q8TD19 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEK9Q8TD19 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEK9Q8TD19 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEK9Q8TD19 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NEK9Q8TD19 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEK9Q8TD19 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEK9Q8TD19 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
NEK9Q8TD19 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEK9Q8TD19 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEK9Q8TD19 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEK9Q8TD19 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEK9Q8TD19 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEK9Q8TD19 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEK9Q8TD19 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEK9Q8TD19 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEK9Q8TD19 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEK9Q8TD19 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NEK9Q8TD19 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEK9Q8TD19 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEK9Q8TD19 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEK9Q8TD19 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEK9Q8TD19 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEK9Q8TD19 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEK9Q8TD19 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEK9Q8TD19 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEK9Q8TD19 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEK9Q8TD19 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEK9Q8TD19 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEK9Q8TD19 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEK9Q8TD19 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEK9Q8TD19 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NEK9Q8TD19 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NEK9Q8TD19 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NEK9Q8TD19 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NEK9Q8TD19 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NEK9Q8TD19 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEK9Q8TD19 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEK9Q8TD19 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEK9Q8TD19 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEK9Q8TD19 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEK9Q8TD19 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEK9Q8TD19 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEK9Q8TD19 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEK9Q8TD19 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEK9Q8TD19 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEK9Q8TD19 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEK9Q8TD19 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEK9Q8TD19 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEK9Q8TD19 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEK9Q8TD19 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEK9Q8TD19 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEK9Q8TD19 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEK9Q8TD19 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEK9Q8TD19 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NEK9Q8TD19 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEK9Q8TD19 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEK9Q8TD19 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NEK9Q8TD19 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEK9Q8TD19 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEK9Q8TD19 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEK9Q8TD19 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEK9Q8TD19 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEK9Q8TD19 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEK9Q8TD19 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEK9Q8TD19 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEK9Q8TD19 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NEK9Q8TD19 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEK9Q8TD19 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEK9Q8TD19 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEK9Q8TD19 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEK9Q8TD19 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEK9Q8TD19 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEK9Q8TD19 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEK9Q8TD19 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEK9Q8TD19 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEK9Q8TD19 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEK9Q8TD19 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEK9Q8TD19 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NEK9Q8TD19 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEK9Q8TD19 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEK9Q8TD19 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEK9Q8TD19 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEK9Q8TD19 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEK9Q8TD19 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEK9Q8TD19 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEK9Q8TD19 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEK9Q8TD19 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEK9Q8TD19 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEK9Q8TD19 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEK9Q8TD19 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEK9Q8TD19 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms