Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFF2

SLC24A4, Sodium/potassium/calcium exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A4Q8NFF2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC24A4Q8NFF2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC24A4Q8NFF2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC24A4Q8NFF2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC24A4Q8NFF2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC24A4Q8NFF2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC24A4Q8NFF2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC24A4Q8NFF2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC24A4Q8NFF2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC24A4Q8NFF2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC24A4Q8NFF2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC24A4Q8NFF2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC24A4Q8NFF2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC24A4Q8NFF2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC24A4Q8NFF2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC24A4Q8NFF2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC24A4Q8NFF2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC24A4Q8NFF2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC24A4Q8NFF2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC24A4Q8NFF2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC24A4Q8NFF2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC24A4Q8NFF2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC24A4Q8NFF2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC24A4Q8NFF2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms